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Enregistrement W3011049427 · doi:10.3390/dairy1010002

Urinary Metabolomics around Parturition Identifies Metabolite Alterations in Dairy Cows Affected Postpartum by Lameness: Preliminary Study

2020· article· en· W3011049427 sur OpenAlexafffund
Guanshi Zhang, Elda Dervishi, Grzegorz Zwierzchowski, Rupasri Mandal, David S. Wishart, Burim N. Ametaj

Notice bibliographique

RevueDairy · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueEffects of Environmental Stressors on Livestock
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesGenome AlbertaAlberta Livestock and Meat Agency
Mots-clésMetaboliteLamenessUrineUrinary systemIce calvingInternal medicineMedicineChemistryDairy cattleEndocrinologyAnimal sciencePhysiologyLactationPregnancyBiologySurgery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

(1) Background: The objective of this study was to evaluate the urine of dairy cows for presence of metabolites with the potential to be used as screening biomarkers for lameness as well as to characterize pre-lame, lame, and post-lame cows from the metabolic prospective. (2) Methods: Six lame and 20 control healthy cows were used in this nested case-control study. Urinary 1H-NMR analysis was used to identify and measure metabolites at five time points including −8 and −4 weeks prepartum, lameness diagnosis week (1–3 weeks postpartum) as well as at +4 and +8 weeks after calving. (3) Results: A total of 90 metabolites were identified and measured in the urine. At −8 and −4 weeks, 27 prepartum metabolites were identified as altered, at both timepoints, with 19 and 5 metabolites excreted at a lower concentration, respectively. Additionally, a total of 8 and 22 metabolites were found at greater concentration in pre-lame cows at −8 and −4 weeks, respectively. Lame cows were identified to excrete, at lower concentrations, seven metabolites during a lameness event with the top five most important metabolites being Tyr, adipate, glycerate, 3-hydroxy-3-methylglutarate, and uracil. Alterations in urinary metabolites also were present at +4 and +8 weeks after calving with N-acetylaspartate, glutamine, imidazole, pantothenate, beta-alanine and trimethylamine, with the greatest VIP (variable importance in projection) score at +4 weeks; and hipurate, pantothenate 1,3-dihydroxyacetone, galactose, and Tyr, with the greatest VIP score at +8 weeks postpartum. (4) Conclusions: Overall, results showed that urine metabotyping can be used to identify cows at risk of lameness and to better characterize lameness from the metabolic prospective. However, caution should be taken in interpretation of the data presented because of the low number of replicates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,848
Score d'incertitude au seuil0,565

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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