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Enregistrement W3011102208 · doi:10.1371/journal.pone.0230458

Cultivar-specific nutritional status of potato (Solanum tuberosum L.) crops

2020· article· en· W3011102208 sur OpenAlexafffundabout
Zonlehoua Coulibali, Athyna N. Cambouris, Sérge-Étienne Parent

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePotato Plant Research
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésCultivarSolanum tuberosumNutrientCropBiologyAgronomyYield (engineering)HorticultureMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gradients in the elemental composition of a potato leaf tissue (i.e. its ionome) can be linked to crop potential. Because the ionome is a function of genetics and environmental conditions, practitioners aim at fine-tuning fertilization to obtain an optimal ionome based on the needs of potato cultivars. Our objective was to assess the validity of cultivar grouping and predict potato tuber yields using foliar ionomes. The dataset comprised 3382 observations in Québec (Canada) from 1970 to 2017. The first mature leaves from top were sampled at the beginning of flowering for total N, P, K, Ca, and Mg analysis. We preprocessed nutrient concentrations (ionomes) by centering each nutrient to the geometric mean of all nutrients and to a filling value, a transformation known as row-centered log ratios (clr). A density-based clustering algorithm (dbscan) on these preprocessed ionomes failed to delineate groups of high-yield cultivars. We also used the preprocessed ionomes to assess their effects on tuber yield classes (high- and low-yields) on a cultivar basis using k-nearest neighbors, random forest and support vector machines classification algorithms. Our machine learning models returned an average accuracy of 70%, a fair diagnostic potential to detect in-season nutrient imbalance of potato cultivars using clr variables considering potential confounding factors. Optimal ionomic regions of new cultivars could be assigned to the one of the closest documented cultivar.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,488
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,115
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,120 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2020
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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