MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3011124433 · doi:10.1186/s13024-020-00369-5

Premature termination codon readthrough upregulates progranulin expression and improves lysosomal function in preclinical models of GRN deficiency

2020· article· en· W3011124433 sur OpenAlexafffund
Jonathan Frew, Alireza Baradaran‐Heravi, Aruna D. Balgi, Xiujuan Wu, Tyler D. Yan, Steve Arns, Fahimeh S. Shidmoossavee, Jason Tan, James B. Jaquith, Karen Jansen‐West, Francis C. Lynn, Fen‐Biao Gao, Leonard Petrucelli, Howard Feldman, Ian R. Mackenzie, Michel Roberge, Haakon B. Nygaard

Notice bibliographique

RevueMolecular Neurodegeneration · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthMichael Smith Health Research BCNational Institute of Neurological Disorders and StrokeWeston Brain Institute
Mots-clésBiologyHaploinsufficiencyNonsense mutationMutationCancer researchInduced pluripotent stem cellGeneticsGeneEmbryonic stem cellPhenotypeMissense mutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Frontotemporal lobar degeneration (FTLD) is a devastating and progressive disorder, and a common cause of early onset dementia. Progranulin (PGRN) haploinsufficiency due to autosomal dominant mutations in the progranulin gene ( GRN ) is an important cause of FTLD (FTLD- GRN ), and nearly a quarter of these genetic cases are due to a nonsense mutation. Premature termination codons (PTC) can be therapeutically targeted by compounds allowing readthrough, and aminoglycoside antibiotics are known to be potent PTC readthrough drugs. Restoring endogenous PGRN through PTC readthrough has not previously been explored as a therapeutic intervention in FTLD. Methods We studied whether the aminoglycoside G418 could increase PGRN expression in HEK293 and human induced pluripotent stem cell (hiPSC)-derived neurons bearing the heterozygous S116X, R418X, and R493X pathogenic GRN nonsense mutations. We further tested a novel substituted phthalimide PTC readthrough enhancer in combination with G418 in our cellular models. We next generated a homozygous R493X knock-in hiPSC isogenic line (R493X −/− KI), assessing whether combination treatment in hiPSC-derived neurons and astrocytes could increase PGRN and ameliorate lysosomal dysfunction relevant to FTLD- GRN . To provide in vivo proof-of-concept of our approach, we measured brain PGRN after intracerebroventricular administration of G418 in mice expressing the V5-tagged GRN nonsense mutation R493X. Results The R418X and R493X mutant GRN cell lines responded to PTC readthrough with G418, and treatments increased PGRN levels in R493X −/− KI hiPSC-derived neurons and astrocytes. Combining G418 with a PTC readthrough enhancer increased PGRN levels over G418 treatment alone in vitro. PGRN deficiency has been shown to impair lysosomal function, and the mature form of the lysosomal protease cathepsin D is overexpressed in R493X −/− KI neurons. Increasing PGRN through G418-mediated PTC readthrough normalized this abnormal lysosomal phenotype in R493X −/− KI neuronal cultures. A single intracerebroventricular injection of G418 induced GRN PTC readthrough in 6-week-old AAV- GRN -R493X-V5 mice. Conclusions Taken together, our findings suggest that PTC readthrough may be a potential therapeutic strategy for FTLD caused by GRN nonsense mutations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMolecular NeurodegenerationMême sujetAmyotrophic Lateral Sclerosis ResearchTravaux en français237 207