Physicochemical characterisation, molecular docking, and drug-likeness evaluation of hypotensive peptides encrypted in flaxseed proteome
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
In this study, hypotensive peptides derived from mature flaxseed protein sequences were predicted in silico using BIOPEP-UWM with nine proteases, three each from digestive, plant and microbial sources. The physicochemical properties of 2256 ACE-inhibitory peptides and 267 renin-inhibitory peptides (including seven (7) peptides with dual inhibitory activities against both ACE and renin enzymes) were assessed in silico using the ‘Peptides’ package of R. The hypotensive peptides showed relatively low molecular weight (mol. wt.) range (132 = mol. wt. ≤ 442 Da); broad range of isoelectric point (3.61 = pI ≤ 12.50); both high (>2) and low (≤2) Boman indices, and a variety of hydrophobicity indices (hydrophilic, hydrophobic and amphipathic properties). Following this, the seven peptides with dual ACE and renin inhibitory activities were selected for molecular docking with the respective enzyme receptors. The binding energies of the seven hypotensive peptides with ACE and renin respectively ranged from −36.82 to −25.94 kJ/mol, and −33.05 to −27.61 kJ/mol; and compared well with values recorded for inhibitor drugs, captopril (−26.78 kJ/mol) and aliskiren (−34.73 kJ/mol). The seven peptides inhibited ACE through hydrogen bonds, electrostatic and hydrophobic interactions; and renin, mainly through hydrogen bonds and hydrophobic interactions. In silico prediction of adsorption, digestion, metabolism, excretion and toxicity (ADME/Tox) profile based on physicochemical properties and Lipinski's rule-of-five showed that the peptides were non-toxic and had desirable drug-like properties (flexibility, lipophilicity, molecular weight, gastrointestinal absorption, and bioavailability). This study provides insight into the molecular interactions of hypotensive peptides with their physiological targets, and the potential to develop the bioactive peptides from flaxseed proteins.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle