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Enregistrement W3011290414 · doi:10.1038/s41598-020-60929-z

Chronic disturbance modulates symbiont (Symbiodiniaceae) beta diversity on a coral reef

2020· article· en· W3011290414 sur OpenAlexafffund
Danielle C. Claar, Kristina L. Tietjen, Kieran Cox, Ruth D. Gates, Julia K. Baum

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueCoral and Marine Ecosystems Studies
Établissements canadiensTula FoundationUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesCentre for Asia-Pacific InitiativesNational Oceanic and Atmospheric AdministrationNational Science FoundationPew Charitable TrustsNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaRufford FoundationDavid and Lucile Packard FoundationUniversity of Victoria
Mots-clésCoralSymbiodiniumEcologyReefCoral reefBiologyDisturbance (geology)ZooxanthellaeScleractiniaSymbiosisIntermediate Disturbance HypothesisHabitatCnidariaPaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chronic disturbance can disrupt ecological interactions including the foundational symbiosis between reef-building corals and the dinoflagellate family Symbiodiniaceae. Symbiodiniaceae are photosynthetic endosymbionts necessary for coral survival, but many Symbiodiniaceae can also be found free-living in the environment. Since most coral species acquire new Symbiodiniaceae from the environment each generation, free-living Symbiodiniaceae represent important pools for coral symbiont acquisition. Yet, little is known about the diversity of, or impacts of disturbance on, free-living Symbiodiniaceae. To determine how chronic and pulse disturbances influence Symbiodiniaceae communities, we sampled three reef habitat compartments - sediment, water, and coral (Pocillopora grandis, Montipora aequituberculata, Porites lobata) - at sites exposed to different levels of chronic anthropogenic disturbance, before, during, and after a major storm. Almost no (4%) Symbiodiniaceae amplicon sequence variants (ASVs) were found in all three compartments, and over half were found uniquely in coral. Sites experiencing chronic disturbance were typically associated with higher symbiont beta diversity (i.e., variability and turnover) across reef habitat compartments. Pulse stress, from the storm, exhibited some influence on symbiont beta diversity but the effect was inconsistent. This suggests that in this ecosystem, the effects of chronic disturbance are more prominent than temporal variability during a pulse disturbance for shaping symbiont communities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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