Construction of High-Density Linkage Maps and Identification of Quantitative Trait Loci Associated with Verticillium Wilt Resistance in Autotetraploid Alfalfa (<i>Medicago sativa</i>L.)
Notice bibliographique
Résumé
Verticillium wilt (VW) of alfalfa is a devastating disease that causes forage yield reductions of up to 50% in the northern United States and Canada. The most effective method for controlling the disease is through the development and use of resistant varieties. To identify quantitative trait loci (QTL) for VW resistance in alfalfa, we used a full-sib population segregating for VW resistance. High-density linkage maps for both resistant and susceptible parents were constructed using single-dose alleles of single-nucleotide polymorphism markers generated by genotyping-by-sequencing. Five QTL associated with VW resistance were identified and they were in four linkage groups (4D, 6B, 6D, and 8C). Of those, three QTL (qVW-6D-1, qVW-6D-2, and qVW-8C) had higher logarithm of odds. Two putative candidates of nucleotide-binding site leucine-rich repeat disease resistance genes were identified in the QTL intervals of qVW-6D-2 and qVW-8C, respectively. The result agreed with our previous studies, in which similar resistance loci were identified in an association panel using genome-wide association. The results provide insight into the quantitative resistance to VW in alfalfa. The resistance loci and closely linked markers identified in the present study can be used in developing new alfalfa varieties with enhanced resistance to VW.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».