Extraction of Total Soluble Lipid from Ground Coral Samples v1
Notice bibliographique
Résumé
This method is adapted and updated from methods originally published in Grottoli et al. (2004) and is based on the original methods of Folch & Stanley (1957), and Bligh & Dyer (1959). There are five parts to extracting lipids from ground corals: 1) grind and sub-sample the coral and store at -80 °C until ready to extract, 2) freeze-dry the sample, 3) extract the lipids from the freeze-dried samples, 4) standardize the lipid concentration to ash-free dry weight (AFDW), and 5) resuspend the extracted lipid for long-term storage and possible later analysis of lipid classes or isotopes. The lipid extraction procedure must be conducted in a fume hood with the sash as low as possible with the researcher wearing protective eyewear, gloves, and lab coat at all times. Important considerations regarding lipid analysis were gained from reading Chapter 1.3 “Lipid extraction, storage, and sample handling” from the textbook Lipid Analysis by Christie (2003). This method was originally developed by Andréa Grottoli and refined by Rowan McLachlan (06-11-18) with the guidance of Dr. Agus Muñoz-Garcia at The Ohio State University. This protocol was written by Rowan McLachlan (03-12-2020). References Bligh, E. G., & Dyer, W. J. (1959). Canadian Journal of Biochemistry and Physiology. Canadian Journal of Biochemistry and Physiology, 37(8), 911–917. Christie, W. W. (2003). Lipid Analysis: Vol. 15, Isolation, Separation, Identification and Structural Analysis of Lipids. Current Opinion Biotechnology (3rd ed., Vol. 4). Oily Press Ltd, UK. Folch, J., Lees, M., & Stanley, G. H. S. (1957). A simple method for the isolation and purification of total lipids from animal tissues. Journal of Biological Chemistry, 226, 497-509. Grottoli A. G., Rodrigues L. J., & Juarez C. (2004). Lipids and stable carbon isotopes in two species of Hawaiian corals, Porites compressa and Montipora verrucosa, following a bleaching event. Marine Biology, 145: 621–631.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,039 | 0,047 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».