Culture dependent analysis of bacterial diversity in Canada’s Raspberry Rising Cave revealed antimicrobial properties
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Bacteria and archaea thrive in terrestrial subsurface environments because of their unique physiology. Over time, these unique microorganisms may have adapted to possess specialized metabolic pathways that sustain their continued existence in caves, one of harshest environments on earth. The present study elucidates cultivation based microbial diversity of the cave sediments and wall scrapings collected from seven different locations in Raspberry Rising Cave located in the Columbia Mountain Range, British Columbia, Canada. A total of 103 cultivable bacteria from the cave were isolated on various agar media including R2A, Hickey-Tresner, and DifcoTM Actinomycetes Isolation agar media. Taxonomical phylogenetic analysis of the 16S rRNA gene of the bacterial isolates identified three major phyla: Proteobacteria (Class: Gammaproteobacteria) (51.45%), Actinobacteria (43.68%) and Bacteroidetes (3.88%). Among them, the major genus was Pseudomonas (48.54%) followed by Rhodococcus (39.80%) and Flavobacterium (3.88%). The genus Janthinobacterium and Arthrobacter contributed about 2.91% each, of the total population. Noteworthy, 0.99% were recognized as endophytic Proteobacteria. Furthermore, these bacterial isolates were evaluated for their potential antimicrobial activities against the multidrug resistant bacterial strains. Two bacterial isolates (RRC23, RRC75) showed antimicrobial activities against multi-drug resistant (MDR) Escherichia coli #15-318 while RRC48 exhibited against methicillin resistant (MRSA) Staphylococcus aureus. The isolates RRC36 and RRC38 were identified to show antimicrobial activities against non-pathogenic isolates of Staphylococcus aureus. To the best of our knowledge, this is the first scientific study conducted and provides the insight in occurrence and distribution of the cultivated bacterial diversity from the Raspberry Rising Cave. Moreover, the antimicrobial properties exhibited by some of the bacterial isolates suggested that this cave system could be a resource for potential antibiotics, drugs or novel biologics of clinical relevance.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle