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Enregistrement W3011545441 · doi:10.1111/ajt.15850

Banff Digital Pathology Working Group: Going digital in transplant pathology

2020· article· en· W3011545441 sur OpenAlexaff
Alton B. Farris, I. Moghe, Simon Wu, Julien Hogan, Lynn D. Cornell, Mariam P. Alexander, Jesper Kers, Anthony J. Demetris, Richard M. Levenson, John Tomaszewski, Laura Barisoni, Yukako Yagi, Kim Solez

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Transplantation · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueAI in cancer detection
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringNational Cancer Institute
Mots-clésDigital pathologyMedicineStandardizationPathologyMedical physicsComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Banff Digital Pathology Working Group (DPWG) was formed in the time leading up to and during the joint American Society for Histocompatibility and Immunogenetics/Banff Meeting, September 23-27, 2019, held in Pittsburgh, Pennsylvania. At the meeting, the 14th Banff Conference, presentations directly and peripherally related to the topic of "digital pathology" were presented; and discussions before, during, and after the meeting have resulted in a list of issues to address for the DPWG. Included are practice standardization, integrative approaches for study classification, scoring of histologic parameters (eg, interstitial fibrosis and tubular atrophy and inflammation), algorithm classification, and precision diagnosis (eg, molecular pathways and therapeutics). Since the meeting, a survey with international participation of mostly pathologists (81%) was conducted, showing that whole slide imaging is available at the majority of centers (71%) but that artificial intelligence (AI)/machine learning was only used in ≈12% of centers, with a wide variety of programs/algorithms employed. Digitalization is not just an end in itself. It also is a necessary precondition for AI and other approaches. Discussions at the meeting and the survey highlight the unmet need for a Banff DPWG and point the way toward future contributions that can be made.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,051
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,054
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,051
Score d'incertitude au seuil0,269

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0510,054
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0070,005
Études des sciences et des technologies0,0040,004
Communication savante0,0120,012
Science ouverte0,0040,013
Intégrité de la recherche0,0100,010
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0500,035

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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