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Enregistrement W3011594667 · doi:10.1001/jamacardio.2020.0246

Association of <i>FADS1/2</i> Locus Variants and Polyunsaturated Fatty Acids With Aortic Stenosis

2020· article· en· W3011594667 sur OpenAlexafffund
Hao Yu Chen, Benjamin J. Cairns, Aeron Small, Hannah A Burr, Athithan Ambikkumar, Andreas Martinsson, Sébastien Thériault, Hans Markus Münter, Brian T. Steffen, Richard Zhang, Rebecca T. Levinson, Christian M. Shaffer, Jian Rong, Emily Sonestedt, Line Dufresne, Johan Ljungberg, Ulf Näslund, Bengt Johansson, Dilrini K. Ranatunga, Rachel A. Whitmer, Matthew J. Budoff, Albert Nguyen, Ramachandran S. Vasan, Martin G. Larson, William S. Harris, Scott M. Damrauer, Ken D. Stark, S. Matthijs Boekholdt, Nicholas J. Wareham, Philippe Pîbarot, Benoît J. Arsenault, Patrick Mathieu, Vilmundur Guðnason, Christopher J. O’Donnell, Jerome I. Rotter, Michael Y. Tsai, Wendy S. Post, Robert Clarke, Stefan Söderberg, Yohan Bossé, Quinn S. Wells, J. G. Smith, Daniel J. Rader, Mark Lathrop, James C. Engert, George Thanassoulis

Notice bibliographique

RevueJAMA Cardiology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac Valve Diseases and Treatments
Établissements canadiensUniversity of WaterlooMcGill University and Génome Québec Innovation CentreUniversité LavalMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Human Genome Research InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteMedical Research CouncilUniversity of California, DavisPerelman School of Medicine, University of PennsylvaniaHáskóli ÍslandsJohns Hopkins UniversityLunds UniversitetUniversity of WaterlooUniversity of California, Los AngelesUniversiteit van AmsterdamNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesNational Institute for Health and Care ResearchUniversity of South DakotaMcGill UniversityNational Center for Research ResourcesUniversity of PennsylvaniaKaiser Permanente
Mots-clésMedicineOdds ratioGenome-wide association studyInternal medicineAortic valve stenosisEpidemiologyGenetic epidemiologyLocus (genetics)StenosisBioinformaticsCardiologyGenotypeGeneticsSingle-nucleotide polymorphismBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Importance: Aortic stenosis (AS) has no approved medical treatment. Identifying etiological pathways for AS could identify pharmacological targets. Objective: To identify novel genetic loci and pathways associated with AS. Design, Setting, and Participants: This genome-wide association study used a case-control design to evaluate 44 703 participants (3469 cases of AS) of self-reported European ancestry from the Genetic Epidemiology Research on Adult Health and Aging (GERA) cohort (from January 1, 1996, to December 31, 2015). Replication was performed in 7 other cohorts totaling 256 926 participants (5926 cases of AS), with additional analyses performed in 6942 participants from the Cohorts for Heart and Aging Research in Genomic Epidemiology (CHARGE) Consortium. Follow-up biomarker analyses with aortic valve calcium (AVC) were also performed. Data were analyzed from May 1, 2017, to December 5, 2019. Exposures: Genetic variants (615 643 variants) and polyunsaturated fatty acids (ω-6 and ω-3) measured in blood samples. Main Outcomes and Measures: Aortic stenosis and aortic valve replacement defined by electronic health records, surgical records, or echocardiography and the presence of AVC measured by computed tomography. Results: The mean (SD) age of the 44 703 GERA participants was 69.7 (8.4) years, and 22 019 (49.3%) were men. The rs174547 variant at the FADS1/2 locus was associated with AS (odds ratio [OR] per C allele, 0.88; 95% CI, 0.83-0.93; P = 3.0 × 10-6), with genome-wide significance after meta-analysis with 7 replication cohorts totaling 312 118 individuals (9395 cases of AS) (OR, 0.91; 95% CI, 0.88-0.94; P = 2.5 × 10-8). A consistent association with AVC was also observed (OR, 0.91; 95% CI, 0.83-0.99; P = .03). A higher ratio of arachidonic acid to linoleic acid was associated with AVC (OR per SD of the natural logarithm, 1.19; 95% CI, 1.09-1.30; P = 6.6 × 10-5). In mendelian randomization, increased FADS1 liver expression and arachidonic acid were associated with AS (OR per unit of normalized expression, 1.31 [95% CI, 1.17-1.48; P = 7.4 × 10-6]; OR per 5-percentage point increase in arachidonic acid for AVC, 1.23 [95% CI, 1.01-1.49; P = .04]; OR per 5-percentage point increase in arachidonic acid for AS, 1.08 [95% CI, 1.04-1.13; P = 4.1 × 10-4]). Conclusions and Relevance: Variation at the FADS1/2 locus was associated with AS and AVC. Findings from biomarker measurements and mendelian randomization appear to link ω-6 fatty acid biosynthesis to AS, which may represent a therapeutic target.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,382

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations64
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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