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Enregistrement W3011642937 · doi:10.1136/jitc-2019-000337

Consensus guidelines for the definition, detection and interpretation of immunogenic cell death

2020· review· en· W3011642937 sur OpenAlexaff
Lorenzo Galluzzi, Ilio Vitale, Sarah H. Warren, Sandy Adjemian, Patrizia Agostinis, Aitziber Buqué Martinez, Timothy A. Chan, George Coukos, Sandra Demaria, Éric Deutsch, Dobrin Draganov, Richard L. Edelson, Silvia C. Formenti, Jitka Fučíková, Lucia Gabriele, Udo S. Gaipl, Sofia R. Gameiro, Abhishek D. Garg, Encouse B. Golden, Jian Han, Kevin J. Harrington, Akseli Hemminki, James W. Hodge, Dewan Md Sakib Hossain, Tim Illidge, Michael Karin, Howard L. Kaufman, Oliver Kepp, Guido Kroemer, Juan José Lasarte, Sherene Loi, Michael T. Lotze, Gwenola Manic, Taha Merghoub, Alan Melcher, Karen Mossman, Felipe Prósper, Øystein Rekdal, María Rescigno, Chiara Riganti, Antonella Sistigu, Mark J. Smyth, Radek Špíšek, John Stagg, Bryan E. Strauss, Daolin Tang, Kazuki Tatsuno, Stefaan Van Gool, Peter Vandenabeele, Takahiro Yamazaki, Dmitriy Zamarin, Laurence Zitvogel, Alessandra Cesano, Francesco M. Marincola

Notice bibliographique

RevueJournal for ImmunoTherapy of Cancer · 2020
Typereview
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePhagocytosis and Immune Regulation
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier de l’Université de MontréalMcMaster University
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroRosetrees TrustNational Institute for Health and Care ResearchCompagnia di San PaoloNational Cancer InstituteCancer Research UKWeill Cornell Medical CollegeU.S. Department of Defense
Mots-clésAcquired immune systemImmune systemProgrammed cell deathImmunogenic cell deathAntigenicityImmunologyMedicineComputer scienceBiologyAntigenImmunotherapyApoptosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cells succumbing to stress via regulated cell death (RCD) can initiate an adaptive immune response associated with immunological memory, provided they display sufficient antigenicity and adjuvanticity. Moreover, multiple intracellular and microenvironmental features determine the propensity of RCD to drive adaptive immunity. Here, we provide an updated operational definition of immunogenic cell death (ICD), discuss the key factors that dictate the ability of dying cells to drive an adaptive immune response, summarize experimental assays that are currently available for the assessment of ICD in vitro and in vivo, and formulate guidelines for their interpretation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,053

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0060,004
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0050,002
Intégrité de la recherche0,0050,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,103
Tête enseignante GPT0,389
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1 061
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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