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Enregistrement W3011725279 · doi:10.1038/s41598-020-61512-2

Phenotypic and Transcriptomic Analysis of Two Pinellia ternata Varieties T2 line and T2Plus line

2020· article· en· W3011725279 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2020
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePlant-based Medicinal Research
Établissements canadiensAir Canada
Organismes subventionnairesScience and Technology Support Program of Jiangsu ProvinceGovernment of Jiangsu ProvinceJiangsu National Synergistic Innovation Center for Advanced MaterialsNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésPinellia ternataTranscriptomeKEGGMYBBiologyPinelliaDe novo transcriptome assemblyRNA-SeqGeneOpium PoppyBotanyGeneticsTranscription factorGene expressionPapaver

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pinellia (Pinellia ternata (Thunb.) Breit.), as important medicinal plant, has been used to treat various ailments for a long time. The sixteen ploid plant (2n = 16 * 13 = 208) Pinellia T2Plus line was obtained from an octoploid (2n = 8 * 13 = 104) T2 line by chromosome-doubling technique. Compared with T2 line, the content of various medicinal components (polysaccharide, guanosine, adenosine and ephedrine) was increased in T2Plus line. In this study, the transcriptome of T2 line and T2Plus line were characterized by RNA sequencing (RNA-seq) technology. Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathways enrichment analysis on differential expressed unigenes (DEGs) revealed that multiple metabolic pathway were enriched significantly, such as 'Starch and sucrose metabolism', 'Purine metabolism', 'Photosynthesis' and six transcription factors (MYB, WRKY, bHLH, lateral organ boundaries domain (LBD), homeodomain-zipper (HD-ZIP) and Ethylene-responsive factor (ERF)) play a key role in difference of transcriptome between T2 line and T2Plus line. These metabolic pathways and transcription factors may play an important role in the difference of medicinal components and epigenetic features between these two Pinellia cultivars. This conclusion provides a robust theoretical basis for the mechanism of the formation of medicinal ingredients in Pinellia cultivars.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,276
Score d'incertitude au seuil0,686

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,157
Tête enseignante GPT0,445
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle