MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3011905462

The role of GATA4 and GATA6 as putative tumor suppressors and co-modulators in astrocytes

2007· article· en· W3011905462 sur OpenAlexaff
Deepak Kamnasaran, Sameer Agnihotri, Cynthia Hawkins, Abhijit Guha

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyCancer researchGliomaWestern blotGATA6GATA4Tumor suppressor genep14arfCarcinogenesisAstrocytomaGene expressionGenePathologyMedicineGenetics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

372 Introduction: Astrocytomas compromise over 60% of all primary human adult central nervous system neoplasms, with Glioblastoma Multiforme (GBM) being the most common and malignant. Our group has previously used an oncogenic V12Ha-Ras mouse model (GEM) for astrocytomas as a “gene-discovery” reagent to screen for genetic modifiers, and identified GATA6 as a late progression tumor suppressor gene (TSG) in both murine and human astrocytomas. Furthermore, using a candidate gene approach, we identified GATA4, a member of the same GATA family of transcription factors, as a possible TSG in gliomas. Our overall objective was to examine the function and expression of both GATA4 and GATA6 in normal and transformed human and murine astrocytes. Methods-Results: Using Real time RT-PCR and western blot analysis, we identified GATA4 as a positive regulator of GATA6 expression, and vice versa in newborn (P0) murine astrocytes but not in adult normal human astrocytes (immortalized with TERT) and in transformed astrocytes (glioma cell lines). The expression of effector genes such as DAB2, WNT7a and BMP2 were regulated positively by both GATA4 and GATA6, unlike some genes such as HNF4a that is regulated only by GATA6. We studied our oncogenic V12Ha-Ras GEM for gliomas and identified both GATA4 and GATA6 as expressed in the low grade astrocytomas (LGA) but with absent expression in high grade astrocytomas (HGA). We next examined panels of human glioma specimens (glioma cell lines, GBM xenografts explants, surgical specimens) using western blot analysis, RT-PCR and immunohistochemistry. We noted the majority of HGAs (60-85%) but only 10-33% of LGAs, with loss of GATA4 and GATA6 expression. We did not find any statistically significant correlation between concurrent altered expression of GATA4 and GATA6, however while more LGAs had loss of GATA4 expression, more HGAs had loss of GATA6 expression. Discussion: Both GATA4 and GATA6 have been implicated as TSGs in cancers such as adrenocortical, gastric and ovarian. We are the first to demonstrate transcriptional regulatory cross talks between GATA4 and GATA6 in astrocytes, with roles as late progression factors in gliomas. Both GATA4 and GATA6 plus their effectors can therefore serve as excellent therapeutic targets in the treatment of gliomas.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,418
Écart entre enseignants0,386 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancer Research→Même sujetGlioma Diagnosis and Treatment→Travaux en français237 207→