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Enregistrement W3011938208 · doi:10.5217/ir.2019.00116

Concordance between tuberculin skin test and interferon-gamma release assay for latent tuberculosis screening in inflammatory bowel disease

2020· article· en· W3011938208 sur OpenAlexaff
Saad Alrajhi, Pascale Germain, Myriam Martel, Péter L. Lakatos, Talat Bessissow, Talal Al-Taweel, Waqqas Afif

Notice bibliographique

RevueIntestinal Research · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineConcordanceLatent tuberculosisImmunosuppressionInternal medicineOdds ratioAzathioprineTuberculinInflammatory bowel diseaseThiopurine methyltransferaseTuberculosisQuantiFERONImmunologyGastroenterologyDiseasePathologyMycobacterium tuberculosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND/AIMS: Latent tuberculosis screening is mandatory prior to initiating anti-tumor necrosis factor (anti-TNF) medications. Guidelines recommend interferon-gamma release assays (IGRA) as first line screening method for the general population. Studies provided conflicting evidence on IGRA and tuberculin skin test (TST) performance in inflammatory bowel disease (IBD) patients. We assessed test concordance and the effects of immunosuppression on their performance in IBD patients. METHODS: We searched MEDLINE, Embase and Cochrane databases (2011-2018) for studies testing TST and IGRA in IBD. Primary outcome was TST and IGRA concordance. Secondary outcomes were effects of immunosuppressive therapy on performance. Immunosuppression defined as either steroids, thiopurine, methotrexate or cyclosporine use. We used the pooled random effects model to adjust for heterogeneity analyzed using (I2-Q statistics). We compared the fixed model to exclude smaller study effects. RESULTS: Sixteen studies (2,488 patients) were included. Pooled TST and IGRA concordance was 85% (95% confidence interval [CI], 81%-88%; P=0.01). Effects of immunosuppression were reported in 8 studies (814 patients). The odds ratio of testing positive by IGRA decreased to 0.57 if immunosuppressed (95% CI, 0.31-1.03; P=0.06). The odds ratio of testing positive by TST if immunosuppressed was 1.14 (95% CI, 0.61-2.12; P=0.69). The fixed model yielded similar results, however the negative effect of immunosuppression on IGRA reached statistical significance (P=0.01). CONCLUSIONS: While concordance was 85% between TST and IGRA, the performance of IGRA seems to be negatively affected by immunosuppression. Given the importance of detecting latent tuberculosis prior to anti-TNF initiation, further randomized controlled trials comparing the performance of TST and IGRA in IBD patients are needed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,045
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,176
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil0,238

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0450,176
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0070,011
Bibliométrie0,0070,007
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,103
Tête enseignante GPT0,391
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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