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Enregistrement W3012093427 · doi:10.1161/circgen.119.002748

Genetic Testing for Diagnosis of Hypertrophic Cardiomyopathy Mimics

2020· article· en· W3012093427 sur OpenAlexaff
Sara Hoss, Manhal Habib, Josh Silver, Melanie Care, Raymond H. Chan, Kate Hanneman, Chantal F. Morel, Robert M. Iwanochko, Michael H. Gollob, Harry Rakowski, Arnon Adler

Notice bibliographique

RevueCirculation Genomic and Precision Medicine · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Tyrosine Phosphatases
Établissements canadiensToronto Western HospitalToronto General HospitalUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHypertrophic cardiomyopathyGenetic testingMedicineNoonan syndromeGenetic diagnosisCardiomyopathyDiseaseInternal medicineCardiologyGeneGeneticsHeart failureBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Genetic testing is helpful for diagnosis of hypertrophic cardiomyopathy (HCM) mimics. Little data are available regarding the yield of such testing and its clinical impact. Methods The HCM genetic database at our center was used for identification of patients who underwent HCM-directed genetic testing including at least 1 gene associated with an HCM mimic ( GLA , TTR , PRKAG2 , LAMP2 , PTPN11 , RAF1 , and DES ). Charts were retrospectively reviewed and genetic and clinical data extracted. Results There were 1731 unrelated HCM patients who underwent genetic testing for at least 1 gene related to an HCM mimic. In 1.45% of cases, a pathogenic or likely pathogenic variant in one of these genes was identified. This included a yield of 1% for Fabry disease, 0.3% for familial amyloidosis, 0.15% for PRKAG2 -related cardiomyopathy, and 1 patient with Noonan syndrome. In the majority of patients, diagnosis of the HCM mimic based on clinical findings alone would have been challenging. Accurate diagnosis of an HCM mimic led to change in management (eg, enzyme replacement therapy) or family screening in all cases. Conclusions Genetic testing is helpful in the diagnosis of HCM mimics in patients with no or few extracardiac manifestations. Adding these genes to all HCM genetic panels should be considered.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,564
Score d'incertitude au seuil0,374

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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