Multiple roles of THY1 in gastric cancer based on data mining
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: THY1 (CD90) is a heavily N-glycosylated, glycophosphatidylinositol (GPI) anchored cell surface protein, which has been implicated in several cancers. But, the specific mechanism and function of the THY1 gene remains unclear in gastric cancer (GC). METHODS: To investigate the function of THY1 in GC and illustrate the potential mechanism, TCGA and FIREBROWSE were used to detect the THY1expression. GEPIA2 and Kaplan-Meier Plotter showed significant correlation among THY1 mRNA level, TNM stage and survival probability of GC patients. RESULTS: THY1 was up-regulated apparently in GC in contrast to normal tissues and linked to TNM stage. GC patients with higher THY1 expression displayed lower overall survival (OS), first progression (FP) and post-progression survival (PPS). In vitro experiments showed that knockdown of THY1 suppressed proliferation, migration while increased autophagy level in GC cells. Immune factors may interact with THY1mRNA in GC and THY1 was found significantly linked with Tregs. CONCLUSIONS: Our findings indicate that higher THY1 level is link to poor prognosis of GC patients. THY1may as well be used as a marker molecule for evaluating the tumor microenvironment status of GC patients and a target for immunotherapy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,008 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».