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Enregistrement W3012331755 · doi:10.1002/rcm.8781

Fragmentation study of clerodane diterpenes from <i>Casearia</i> species by tandem mass spectrometry (quadrupole time‐of‐flight and ion trap)

2020· article· en· W3012331755 sur OpenAlexaff
Amanda Danuello, Rogério Cardoso de Castro, Alan César Pilon, Paula Carolina Pires Bueno, Marcos Pivatto, Gerardo Magela Vieira Júnior, Flávio Alexandre Carvalho, Fernando Bombarda Oda, Consuelo J. Perez, Norberto Peporine Lopes, André Gonzaga dos Santos, Demian R. Ifa, Alberto José Cavalheiro

Notice bibliographique

RevueRapid Communications in Mass Spectrometry · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiquePlant-Derived Bioactive Compounds
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Mots-clésChemistryTandem mass spectrometryFragmentation (computing)Mass spectrometryCollision-induced dissociationQuadrupole ion trapIon trapElectrospray ionizationTandemStereochemistryChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rationale Clerodane‐type diterpenes from Casearia species show important pharmacological activites such as antitumor, antimicrobial and anti‐inflamatory. There are several mass spectrometry (MS)‐based methods for identification of diterpenes; however, there is still a lack of MS procedures capable of providing characteristic fragmentation pathways for a rapid and unambiguous elucidation of casearin‐like compounds. Methods Casearin‐like compounds were investigated by electrospray ionization tandem mass spectrometry (ESI‐MS/MS). The fragmentation studies were carried out by tandem mass spectrometry in space (quadrupole time‐of‐flight (QTOF)) using different collision energies and also by tandem mass spectrometry in time (QIT) by selective isolation of product ions. Results Casearin‐like compounds presented a predominance of sodium‐ and potassium‐cationized precursor ions. Both QIT and QTOF techniques provided sequential neutral losses of esters related to the R 1 to R 5 substituents linked to the nucleus of the clerodane diterpenes. The fragmentation pathway is initiated with a cleavage of the ester moieties R 2 followed by the elimination of the ester groups R 3 , both losing neutral carboxylic acids. Using QIT, it was also possible to observe the cleavage of the ester groups R 1 or R 5 by MS 4 experiments. Conclusions Through a rational analysis of the fragmentation mechanisms of Casearia diterpenes it was possible to suggest an annotation strategy based on the sequential cleavages of the ester groups related to the R 2 , R 3 and R 5 substituents. These results will assist studies of the dereplication and metabolomics involving casearin‐like compounds present in complex extracts of Casearia species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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