Fragmentation study of clerodane diterpenes from <i>Casearia</i> species by tandem mass spectrometry (quadrupole time‐of‐flight and ion trap)
Notice bibliographique
Résumé
Rationale Clerodane‐type diterpenes from Casearia species show important pharmacological activites such as antitumor, antimicrobial and anti‐inflamatory. There are several mass spectrometry (MS)‐based methods for identification of diterpenes; however, there is still a lack of MS procedures capable of providing characteristic fragmentation pathways for a rapid and unambiguous elucidation of casearin‐like compounds. Methods Casearin‐like compounds were investigated by electrospray ionization tandem mass spectrometry (ESI‐MS/MS). The fragmentation studies were carried out by tandem mass spectrometry in space (quadrupole time‐of‐flight (QTOF)) using different collision energies and also by tandem mass spectrometry in time (QIT) by selective isolation of product ions. Results Casearin‐like compounds presented a predominance of sodium‐ and potassium‐cationized precursor ions. Both QIT and QTOF techniques provided sequential neutral losses of esters related to the R 1 to R 5 substituents linked to the nucleus of the clerodane diterpenes. The fragmentation pathway is initiated with a cleavage of the ester moieties R 2 followed by the elimination of the ester groups R 3 , both losing neutral carboxylic acids. Using QIT, it was also possible to observe the cleavage of the ester groups R 1 or R 5 by MS 4 experiments. Conclusions Through a rational analysis of the fragmentation mechanisms of Casearia diterpenes it was possible to suggest an annotation strategy based on the sequential cleavages of the ester groups related to the R 2 , R 3 and R 5 substituents. These results will assist studies of the dereplication and metabolomics involving casearin‐like compounds present in complex extracts of Casearia species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».