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Enregistrement W3012425929 · doi:10.1200/jco.2006.24.18_suppl.7163

Previously documented mutations in the epidermal growth factor receptor (EGFR) gene in a non-small cell lung cancer (NSCLC) population treated with gefitinib are not associated with response

2006· article· en· W3012425929 sur OpenAlexaff
D. Gwyn Bebb, Trevor J. Pugh, Margaret Sutcliffe, Lorena Barclay, John Fee, Richard A. O’Connor, J. Vielkind, Nevin Murray, Janessa Laskin, Marco A. Marra

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLung Cancer Treatments and Mutations
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGefitinibMedicineLung cancerEpidermal growth factor receptorMicrodissectionCancer researchExonPopulationAdenocarcinomaLaser capture microdissectionEGFR inhibitorsOncologyCancerInternal medicineGeneBiologyGeneticsGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

7163 Background: Mutations in the tyrosine kinase domain of EGFR that may correlate with clinical features and response of NSCLC to EGFR tyrosine kinase inhibitors have been described. But, varying methodologies have contributed to an uncertain relationship between EGFR mutational status and response. This study sought to characterize EGFR mutations in microdissected tumour tissue from pts with advanced NSCLC treated with gefitinib and correlate their clinical data. Methods: Biopsy material from pts treated with gefitinib for advanced NSCLC at the British Columbia Cancer Agency was analyzed. Malignant cells (cytology specimens) or tissue (paraffin embedded biopsies) was reviewed and tumour cells isolated by laser- capture microdissection or manual scrape. Genomic DNA was extracted and exons coding for the EGFR tyrosine kinase domain (18 - 24) were amplified by PCR and sequenced. When insufficient, the priority was 18, 19, 21, followed by 20, 23, 22, and 24. EGFR mutational analyses were correlated with response to gefitinib and clinical features. Results: 61 pts were identified, 14 (23%) radiological responders (CR, PR): 10 Asian, 10 female, 8 non-smokers, 8 adenocarcinoma, 2 BAC. Of 51 tumour samples available, 39 had adequate tissue for sequencing analysis. EGFR copy number by FISH is pending. Laser-capture microdissection allowed for high quality DNA to be extracted almost exclusively from tumour. Exons 18, 19, 20, 21, 22, 23 and 24 have been sequenced in 37, 34, 30, 33, 12, 10, and 13 patients, respectively. 4 mutations were identified: 2 in 2 non-smoking Asian pts (exon 19; deletion or substitution of L747-T751) and 2 in Caucasians (exon 20 point mutation resulting in a L798F substitution). None of these pts had a response to gefitinib. Conclusions: As with other series, most responders were female, non-smokers of Asian origin. Our results support the relationship between Asian ethnicity and EGFR mutations but question the role of EGFR mutational status in predicting response. Prospective studies will need to focus the detection of additional genetic features using accurate and reproducible techniques before recommendations for selecting populations to be treated can be made. No significant financial relationships to disclose.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,416
Écart entre enseignants0,373 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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