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Enregistrement W3012458379 · doi:10.1002/mp.14130

Inter‐ and intra‐software reproducibility of computed tomography lung density measurements

2020· article· en· W3012458379 sur OpenAlexaff
Miranda Kirby, Charles R. Hatt, Nancy A. Obuchowski, Stephen M. Humphries, Jered Sieren, David A. Lynch, Sean B. Fain

Notice bibliographique

RevueMedical Physics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Obstructive Pulmonary Disease (COPD) Research
Établissements canadiensToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesGE HealthcareNational Institutes of HealthNational Heart, Lung, and Blood InstituteSunovionNovartisGlaxoSmithKlineCOPD FoundationGenentechAstraZeneca
Mots-clésReproducibilityHounsfield scaleNuclear medicineMedicinePercentileQuality assuranceComputed tomographyTomographyRadiologyMathematicsStatisticsPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Purpose Multiple commercial, open‐source, and academic software tools exist for objective quantification of lung density in computed tomography (CT) images. The purpose of this study was to evaluate the intersoftware reproducibility of CT lung density measurements. Methods Computed tomography images from 50 participants from the COPDGeneTM cohort study were randomly selected for analysis; n = 10 participants across each global initiative for chronic obstructive lung disease (GOLD) grade (GOLD 0–IV). Academic‐based groups (n = 4) and commercial vendors (n = 4) participated anonymously to generate CT lung density measurements using their software tools. Computed tomography total lung volume (TLV), percentage of the low attenuation areas in the lung with Hounsfield unit (HU) values below −950HU (LAA950), and the HU value corresponding to the 15th percentile on the parenchymal density histogram (Perc15) were included in the analysis. The intersoftware bias and reproducibility coefficient (RDC) was generated with and without quality assurance (QA) for manual correction of the lung segmentation; intrasoftware bias and RDC was also generated by repeated measurements on the same images. Results Intersoftware mean bias was within ±0.22 mL, ±0.46%, and ±0.97 HU for TLV, LAA950 and Perc15, respectively. The RDC was 0.35 L, 1.2% and 1.8 HU for TLV, LAA950 and Perc15, respectively. Intersoftware RDC remained unchanged following QA: 0.35 L, 1.2% and 1.8 HU for TLV, LAA950 and Perc15, respectively. All software investigated had an intrasoftware RDC of 0. The RDC was comparable for TLV, LAA950 and Perc15 measurements, respectively, for academic‐based groups/commercial vendor‐based software tools: 0.39 L/0.32 L, 1.2%/1.2%, and 1.7 HU/1.6 HU. Multivariable regression analysis showed that academic‐based software tools had greater within‐subject standard deviation of TLV than commercial vendors, but no significant differences between academic and commercial groups were found for LAA950 or Perc15 measurements. Conclusions Computed tomography total lung volume and lung density measurement bias and reproducibility was reported across eight different software tools. Bias was negligible across vendors, reproducibility was comparable for software tools generated by academic‐based groups and commercial vendors, and segmentation QA had negligible impact on measurement variability between software tools. In summary, results from this study report the amount of additional measurement variability that should be accounted for when using different software tools to measure lung density longitudinally with well‐standardized image acquisition protocols. However, intrasoftware reproducibility was deterministic for all cases so use of the same software tool to reduce variability for serial studies is highly recommended.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,035
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,062
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Reproductibilité · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,965
Score d'incertitude au seuil0,187

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0350,062
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
DomaineReproductibilité
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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