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Enregistrement W3012785442 · doi:10.1186/s13072-020-00331-1

JMJD1B, a novel player in histone H3 and H4 processing to ensure genome stability

2020· article· en· W3012785442 sur OpenAlexfundno aff
Francisco Saavedra, Zachary A. Gurard‐Levin, Camila Rojas-Villalobos, Isabelle Vassias, Raquel Quatrini, Geneviève Almouzni, Alejandra Loyola

Notice bibliographique

RevueEpigenetics & Chromatin · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesComisión Nacional de Investigación Científica y TecnológicaUniversity of SeoulH2020 European Research CouncilFondo Nacional de Desarrollo Científico y TecnológicoAgence Nationale de la RechercheChung-Ang UniversityYork UniversityUniversity of Dundee
Mots-clésBiologyHistone H3Human geneticsGenomeGeneticsComputational biologyHistoneDNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Maintaining a proper supply of soluble histones throughout the cell cycle is important to ensure chromatin and genome stability. Following their synthesis, histones undergo a series of maturation steps to prepare them for deposition onto chromatin. RESULTS: Here, we identify the lysine demethylase JMJD1B as a novel player in the maturation cascade that contributes to regulate histone provision. We find that depletion of JMJD1B increases the protein levels of the histone chaperone tNASP leading to an accumulation of newly synthesized histones H3 and H4 at early steps of the histone maturation cascade, which perturbs chromatin assembly. Furthermore, we find a high rate of JMJD1B mutations in cancer patients, and a correlation with genomic instability. CONCLUSIONS: Our data support a role for JMJD1B in fine-tuning histone supply to maintain genome integrity, opening novel avenues for cancer therapeutics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,547
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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