The general impact of haploinsufficiency on brain connectivity underlies the pleiotropic effect of neuropsychiatric CNVs
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Copy number variants (CNVs) are among the most highly penetrant genetic risk factors for neuropsychiatric disorders. Their impact on brain connectivity remains mostly unstudied. Because they confer risk for overlapping conditions, we hypothesized that they may converge on shared connectivity patterns. We performed connectome-wide analyses using resting-state functional MRI data from 436 carriers of neuropsychiatric CNVs at the 1q21.1, 15q11.2, 16p11.2, 22q11.2 loci, 4 “neutral effect” CNVs, 66 carriers of scarcer neuropsychiatric CNVs, 756 individuals with idiopathic autism spectrum disorder (ASD), schizophrenia, attention deficit hyperactivity disorder, and 5,377 controls. Neuropsychiatric CNVs showed global shifts of mean connectivity. The effect size of CNVs on relative connectivity (adjusted for the mean) was correlated with the known level of neuropsychiatric risk conferred by CNVs. Individuals with idiopathic schizophrenia and ASD had similarities in connectivity with neuropsychiatric CNVs. We reported a linear relationship between connectivity and intolerance to haploinsufficiency measured for all genes encompassed by CNVs across 18 loci. This profile involved the thalamus, the basal ganglia, somatomotor and frontoparietal networks and was correlated with lower general intelligence and higher autism severity scores. An exploratory factor analysis confirmed the contribution of these regions to three latent components shared across CNVs and neuropsychiatric disorders. We posit that deleting genes intolerant to haploinsufficiency reorganize connectivity along general dimensions irrespective of where deletions occur in the genome. This haploinsufficiency brain signature opens new avenues to understand polygenicity in psychiatric conditions and the pleiotropic effect of CNVs on cognition and risk for neuropsychiatric disorders. One sentence summary Neuropsychiatric CNVs across the genome reorganize brain connectivity architecture along dominant patterns contributing to complex idiopathic conditions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».