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Enregistrement W3012884855 · doi:10.1111/mec.15406

Is Niagara Falls a barrier to gene flow in riverine fishes? A test using genome‐wide SNP data from seven native species

2020· article· en· W3012884855 sur OpenAlexafffund
Nathan K. Lujan, Jason T. Weir, Brice P. Noonan, Nathan R. Lovejoy, Nicholas E. Mandrak

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueFish Ecology and Management Studies
Établissements canadiensThe Scarborough HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFisheries and Oceans CanadaUniversity of TorontoGovernment of Ontario
Mots-clésBiological dispersalEcologyBiologyGene flowHabitatGenetic diversityPopulationGlacial periodPaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Since the early Holocene, fish population genetics in the Laurentian Great Lakes have been shaped by the dual influences of habitat structure and post-glacial dispersal. Riverscape genetics theory predicts that longitudinal habitat corridors and unidirectional downstream water-flow drive the downstream accumulation of genetic diversity, whereas post-glacial dispersal theory predicts that fish genetic diversity should decrease with increasing distance from glacial refugia. This study examines populations of seven native fish species codistributed above and below the 58 m high Niagara Falls - a hypothesized barrier to gene flow in aquatic species. A better understanding of Niagara Falls' role as a barrier to gene flow and dispersal is needed to identify drivers of Great Lakes genetic diversity and guide strategies to limit exotic species invasions. We used genome-wide SNPs and coalescent models to test whether populations are: (a) genetically distinct, consistent with the Niagara Falls barrier hypothesis; (b) more genetically diverse upstream, consistent with post-glacial expansion theory, or downstream, consistent with the riverscape habitat theory; and (c) have migrated either upstream or downstream past Niagara Falls. We found that genetic diversity is consistently greater below Niagara Falls and the falls are an effective barrier to migration, but two species have probably dispersed upstream past the falls after glacial retreat yet before opening of the Welland Canal. Models restricting migration to after opening of the Welland Canal were generally rejected. These results help explain how river habitat features affect aquatic species' genetic diversity and highlight the need to better understand post-glacial dispersal pathways.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,974
Score d'incertitude au seuil0,051

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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