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Enregistrement W3012915235 · doi:10.1371/journal.pone.0230586

Differential role of planar cell polarity gene Vangl2 in embryonic and adult mammalian kidneys

2020· article· en· W3012915235 sur OpenAlexafffund
Ida Derish, Jeremy K. H. Lee, Melanie Wong-King-Cheong, Sima Babayeva, Jillian Caplan, Vicki Leung, Chloe Shahinian, Michel Gravel, Michael R. Deans, Philippe Gros, Elena Torban

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRenal and related cancers
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesNational Institute on Deafness and Other Communication DisordersCanadian Institutes of Health ResearchKidney Foundation of Canada
Mots-clésConvergent extensionBiologyCell biologyKidney developmentApical constrictionMorphogenesisPolycystic kidney diseaseEmbryonic stem cellKidneyCell polarityEpithelial polarityWnt signaling pathwayAnatomyEpitheliumInternal medicineEmbryogenesisEndocrinologyGeneGeneticsCellEmbryoSignal transductionMedicineGastrulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Planar cell polarity (PCP) pathway is crucial for tissue morphogenesis. Mutations in PCP genes cause multi-organ anomalies including dysplastic kidneys. Defective PCP signaling was postulated to contribute to cystogenesis in polycystic kidney disease. This work was undertaken to elucidate the role of the key PCP gene, Vangl2, in embryonic and postnatal renal tubules and ascertain whether its loss contributes to cyst formation and defective tubular function in mature animals. We generated mice with ubiquitous and collecting duct-restricted excision of Vangl2. We analyzed renal tubules in mutant and control mice at embryonic day E17.5 and postnatal days P1, P7, P30, P90, 6- and 9-month old animals. The collecting duct functions were analyzed in young and adult mutant and control mice. Loss of Vangl2 leads to profound tubular dilatation and microcysts in embryonic kidneys. Mechanistically, these abnormalities are caused by defective convergent extension (larger tubular cross-sectional area) and apical constriction (cuboidal cell shape and a reduction of activated actomyosin at the luminal surface). However, the embryonic tubule defects were rapidly resolved by Vangl2-independent mechanisms after birth. Normal collecting duct architecture and functions were found in young and mature animals. During embryogenesis, Vangl2 controls tubular size via convergent extension and apical constriction. However, rapidly after birth, PCP-dependent control of tubular size is switched to a PCP-independent regulatory mechanism. We conclude that loss of the Vangl2 gene is dispensable for tubular elongation and maintenance postnatally. It does not lead to cyst formation and is unlikely to contribute to polycystic kidney disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,177
Écart entre enseignants0,168 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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