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Enregistrement W3013096074 · doi:10.1101/2020.03.31.018226

Overexpression of the chloroplastic 2-oxoglutarate/malate transporter in rice disturbs carbon and nitrogen homeostasis

2020· preprint· en· W3013096074 sur OpenAlexaff
Shirin Zamani-Nour, Hsiang‐Chun Lin, Berkley J. Walker, Tabea Mettler‐Altmann, Roxana Khoshravesh, Shanta Karki, Efren Bagunu, Tammy L. Sage, W. Paul Quick, Andreas P.M. Weber

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant nutrient uptake and metabolism
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésChloroplastBiochemistryCitrate synthasePhotosynthesisC4 photosynthesisBiologyOryza sativaNitrogen assimilationMalate dehydrogenasePhosphoenolpyruvate carboxylaseVascular bundleGlutamate synthaseRuBisCOGlutamate dehydrogenaseBotanyEnzymeGlutamate receptorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The chloroplastic oxaloacetate/malate transporter (OMT1 or DiT1) takes part in the malate valve that protects chloroplasts from excessive redox poise through export of malate and import of oxaloacetate (OAA). Together with the glutamate/malate transporter (DCT1 or DiT2), it connects carbon with nitrogen assimilation, by providing α-ketoglutarate for the GS/GOGAT reaction and exporting glutamate to the cytoplasm. OMT1 further plays a prominent role in C 4 photosynthesis. OAA resulting from PEP-carboxylation is imported into the chloroplast, reduced to malate by plastidic NADP-MDH, and then exported for transport to bundle sheath cells. Both transport steps are catalyzed by OMT1, at the rate of net carbon assimilation. Therefore, to engineer C 4 photosynthesis into C 3 crops, OMT1 must be expressed in high amounts on top of core C 4 metabolic enzymes. We report here high-level expression of ZmOMT1 from maize in rice ( Oryza sativa ssp. indica IR64). Increased activity of the transporter in transgenic rice was confirmed by reconstitution of transporter activity into proteoliposomes. Unexpectedly, over-expression of ZmOMT1 in rice negatively affected growth, CO 2 assimilation rate, total free amino acid contents, TCA cycle metabolites, as well as sucrose and starch contents. Accumulation of high amounts of aspartate and the impaired growth phenotype of OMT1 rice lines could be suppressed by simultaneous over-expression of ZmDiT2 . Implications for engineering C 4 -rice are discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,185
Écart entre enseignants0,171 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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