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Enregistrement W3013110559 · doi:10.1111/tpj.14752

<i>FLOURY ENDOSPERM11‐2</i> encodes plastid HSP70‐2 involved with the temperature‐dependent chalkiness of rice (<i>Oryza sativa</i> L.) grains

2020· article· en· W3013110559 sur OpenAlexfundno aff
Rehenuma Tabassum, Tokinori Dosaka, Hiroyuki Ichida, Ryouhei Morita, Yifan Ding, Tomoko Abe, Tomoyuki Katsube‐Tanaka

Notice bibliographique

RevueThe Plant Journal · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHeat shock proteins research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsJapan Society for the Promotion of Science
Mots-clésMutantBiologyOryza sativaWild typePlastidGeneAmino acidBiochemistryBotanyGeneticsChloroplast

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary The frequent occurrence of chalky rice ( Oryza sativa L.) grains becomes a serious problem as a result of climate change. The molecular mechanism underlying chalkiness is largely unknown, however. In this study, the temperature‐sensitive floury endosperm11‐2 ( flo11‐2 ) mutant was isolated from ion beam‐irradiated rice of 1116 lines. The flo11‐2 mutant showed significantly higher chalkiness than the wild type grown under a mean temperature of 28°C, but similar levels of chalkiness to the wild type grown under a mean temperature of 24°C. Whole‐exome sequencing of the flo11‐2 mutant showed three causal gene candidates, including Os12g0244100 , which encodes the plastid‐localized 70‐kDa heat shock protein 2 (cpHSP70‐2). The cpHSP70‐2 of the flo11‐2 mutant has an amino acid substitution on the 259th aspartic acid with valine (D259V) in the conserved Motif 5 of the ATPase domain. Transgenic flo11‐2 mutants that express the wild‐type cpHSP70‐2 showed significantly lower chalkiness than the flo11‐2 mutant. Moreover, the accumulation level of cpHSP70‐2 was negatively correlated with the chalky ratio, indicating that cpHSP70‐2 is a causal gene for the chalkiness of the flo11‐2 mutant. The intrinsic ATPase activity of recombinant cpHSP70‐2 was lower by 23% at V max for the flo11‐2 mutant than for the wild type. The growth of DnaK‐defective Escherichia coli cells complemented with DnaK with the D201V mutation (equivalent to the D259V mutation) was severely reduced at 37°C, but not in the wild‐type DnaK. The results indicate that the lowered cpHSP70‐2 function is involved with the chalkiness of the flo11‐2 mutant.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,433

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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