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Enregistrement W3013194592 · doi:10.1021/acs.jpcb.0c00945

Structure of a Parkinson’s Disease-Involved α-Synuclein Peptide Is Modulated by Membrane Composition and Physical State

2020· article· en· W3013194592 sur OpenAlexafffund
Benjamin Martial, Gabrielle Raîche-Marcoux, Thierry Lefèvre, Pierre Audet, Normand Voyer, Michéle Auger

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensPROTEOUniversité LavalRegroupement Québécois sur les Matériaux de Pointe
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesCanadian Network for Research and Innovation in Machining Technology, Natural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversité Laval
Mots-clésMembraneChemistryFibrillogenesisBiophysicsFibrilSolid-state nuclear magnetic resonancePeptideAlpha-synucleinCrystallographyBiochemistryParkinson's diseaseNuclear magnetic resonanceBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

α-Synuclein (AS), the protein responsible for Parkinson’s disease, contains a 12-residue-long sequence, AS 71–82, that is thought to play a crucial role in the α-synuclein aggregation process. Neuronal membranes are direct interacting partners of α-synuclein and play a role in fibrillogenesis by providing a charged catalytic surface, notably from anionic phospholipids. However, details are lacking regarding the impact of membrane composition and the driving forces leading to membrane anchorage and peptide structure conversion. To decipher the interplay of α-synuclein with neuronal membranes, the structure of AS 71–82 was investigated in the presence of anionic model membranes. Infrared (IR) spectroscopy and solid-state nuclear magnetic resonance data show that AS 71–82 adopts a perfectly in-register parallel β-sheet structure with fibrillar morphology upon interactions with anionic model membranes. IR thermotropism experiments conducted with several membrane compositions revealed that the phospholipids’ phase transition induces a rearrangement of the AS 71–82 β-sheet structure. In contrast, membranes are not significantly affected by the presence of AS 71–82, which advocates for the amyloid fibrils to lie loosely on the membrane surface. The results bring new arguments for the lipid-sensing capabilities of AS 71–82 and revealed its protofibrillar structure. The striking similarities between AS 71–82 and α-synuclein make it a potential good aggregation inhibitor upon chemical modifications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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