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Enregistrement W3013252558 · doi:10.1038/s41391-020-0226-2

Performance of clinicopathologic models in men with high risk localized prostate cancer: impact of a 22-gene genomic classifier

2020· article· en· W3013252558 sur OpenAlexaff
Jeffrey J. Tosoian, Samuel R. Birer, R. Jeffrey Karnes, Jingbin Zhang, Elai Davicioni, Eric A. Klein, Stephen J. Freedland, Sheila Weinmann, Bruce J. Trock, Robert T. Dess, Shuang G. Zhao, Will Jackson, Kosj Yamoah, Alan Dal Pra, Brandon A. Mahal, Todd M. Morgan, Rohit Mehra, Samuel D. Kaffenberger, Simpa S. Salami, Christopher J. Kane, Alan Pollack, Robert B. Den, Alejandro Berlín, Edward M. Schaeffer, Paul L. Nguyen, Felix Y. Feng, Daniel E. Spratt

Notice bibliographique

RevueProstate Cancer and Prostatic Diseases · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreDecipher Biosciences (Canada)
Organismes subventionnairesDivision of Cancer Epidemiology and Genetics, National Cancer InstituteNational Cancer InstituteU.S. Department of Health and Human ServicesProstate Cancer FoundationNational Institutes of HealthMyriad GeneticsU.S. Department of Defense
Mots-clésMedicineProstate cancerProstatectomyInternal medicineHazard ratioProportional hazards modelOncologyConfidence intervalReceiver operating characteristicAndrogen deprivation therapyRetrospective cohort studyCancerMetastasis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,033

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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