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Enregistrement W3013366438 · doi:10.2196/16008

Prediction of Medical Concepts in Electronic Health Records: Similar Patient Analysis

2020· article· en· W3013366438 sur OpenAlexvenueno aff
Nhat Le, Matthew Wiley, Antonio Loza, Vagelis Hristidis, Robert El‐Kareh

Notice bibliographique

RevueJMIR Medical Informatics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueMachine Learning in Healthcare
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Science Foundation
Mots-clésHealth recordsMedical recordElectronic health recordComputer scienceData scienceMedicineMedical emergencyHealth careRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Medicine 2.0-the adoption of Web 2.0 technologies such as social networks in health care-creates the need for apps that can find other patients with similar experiences and health conditions based on a patient's electronic health record (EHR). Concurrently, there is an increasing number of longitudinal EHR data sets with rich information, which are essential to fulfill this need. OBJECTIVE: This study aimed to evaluate the hypothesis that we can leverage similar EHRs to predict possible future medical concepts (eg, disorders) from a patient's EHR. METHODS: We represented patients' EHRs using time-based prefixes and suffixes, where each prefix or suffix is a set of medical concepts from a medical ontology. We compared the prefixes of other patients in the collection with the state of the current patient using various interpatient distance measures. The set of similar prefixes yields a set of suffixes, which we used to determine probable future concepts for the current patient's EHR. RESULTS: We evaluated our methods on the Multiparameter Intelligent Monitoring in Intensive Care II data set of patients, where we achieved precision up to 56.1% and recall up to 69.5%. For a limited set of clinically interesting concepts, specifically a set of procedures, we found that 86.9% (353/406) of the true-positives are clinically useful, that is, these procedures were actually performed later on the patient, and only 4.7% (19/406) of true-positives were completely irrelevant. CONCLUSIONS: These initial results indicate that predicting patients' future medical concepts is feasible. Effectively predicting medical concepts can have several applications, such as managing resources in a hospital.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,977
Score d'incertitude au seuil0,526

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,315 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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