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Enregistrement W3013540513 · doi:10.1139/cjps-2019-0250

Jasmonic acid–induced inhibition of root growth and leaf senescence is reduced by <i>GmbHLH3</i>, a soybean bHLH transcription factor

2020· article· en· W3013540513 sur OpenAlexvenueno aff
Tianliang Wang, Shuo Wang, Ying Wang, Jingwen Li, Fan Yan, Yajing Liu, Lei Zhao, Qingyu Wang

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésJasmonic acidMethyl jasmonateBiologyBimolecular fluorescence complementationTranscription factorArabidopsisBasic helix-loop-helixJasmonateGeneArabidopsis thalianaGene expressionCell biologyTranscription (linguistics)Wild typeSenescenceGeneticsMutantDNA-binding protein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Basic helix-loop-helix (bHLH) transcription factors (TFs) are known to play significant roles in plant growth and development, secondary metabolite synthesis, and stress responses. However, the functions of soybean [Glycine max (L.) Merr.] bHLH TFs have been less widely explored. The main purpose of this study was to explore the function of a bHLH TF subfamily gene, GmbHLH3, by overexpression in wild type Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. GmbHLH3 is a homolog of Arabidopsis bHLH3 (AtbHLH3) that participates in the regulation of jasmonic acid (JA) signaling. Several cis-regulatory elements responding to methyl-jasmonate (MeJA), including G-Box CGTCA and TGACG motifs, were found in the promoter of GmbHLH3. GmbHLH3 is located in the nucleus. It can form dimers with AtbHLH3, AtbHLH13, and GmbHLH3a, respectively, by yeast two-hybrid and bimolecular fluorescence complementation assay. GmbHLH3 induced root growth by suppressing expression of AtPDF1.2, AtVSPP1, AtLOX2, and AtTAT1 under MeJA treatment. GmbHLH3 inhibited JA-induced leaf senescence by limiting transcription levels of the senescence-related genes AtSAG29, AtAZF2, AtWRKY22, and AtMKP2, and the chlorophyll degradation genes AtSGR, AtNYC1, AtCLH1, AtPPH, and AtPAO. Under long day conditions, in the absence of JA treatment the GmbHLH3-overexpression lines tended to have a reduced time to flowering. Moreover, GmbHLH3 transcript expression pattern analysis revealed that MeJA treatment could induce GmbHLH3 transcript in soybean. This study provides evidence that JA treatment alters the effects of GmbHLH3 on the regulation of plant growth and gene expression. It contributes to future research on the functions of bHLH TFs in soybean.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,450

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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