Applying functional genomics to the study of lamprey development and sea lamprey population control
Notice bibliographique
Résumé
Lampreys are one of the few survivors of an ancient lineage of jawless vertebrates and have become an important study organism in numerous disciplines in the biological sciences, including evolutionary biology, embryology, ecology, physiology and biomedicine. At the same time, however, lampreys have created economic and ecological problems due, primarily, to the invasion of parasitic sea lamprey (Petromyzon marinus) into the North American Great Lakes and consequent negative impacts on local fish populations. Barriers, trapping and lampricide treatments have reduced these impacts, but concern for habitat restoration, non-target effects and possible evolution of resistance to lampricides suggests the need to develop additional strategies that supplement current control measures. The advent of functional genomics, and in particular CRISPR/Cas9 genome editing, offers a molecular approach to this on-going problem. Here, we review the successful application of functional genetic, transcriptomic, and CRISPR/Cas9 genome editing technologies in lampreys to address basic research questions in the fields of evolutionary and developmental biology. We then describe how these tools may be repurposed for use by fishery and conservation biologists to approach the problem of invasive sea lamprey from a molecular-genetic perspective.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».