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Enregistrement W3013910154 · doi:10.1101/2020.03.25.20040592

Latent clinical-anatomical dimensions of schizophrenia

2020· preprint· en· W3013910154 sur OpenAlexafffund
Matthias Kirschner, Golia Shafiei, Ross D. Markello, Carolina Makowski, Alexandra Talpalaru, Benazir Hodzic-Santor, Gabriel A. Devenyi, Casey Paquola, Boris C. Bernhardt, Martín Lepage, M. Mallar Chakravarty, Alain Dagher, Bratislav Mišić

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensDouglas Mental Health University InstituteMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthCanadian Institutes of Health ResearchCanada First Research Excellence FundNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcGill University
Mots-clésSchizophrenia (object-oriented programming)CognitionNeuropsychologyDefault mode networkNeuroimagingPsychologyVoxel-based morphometryNeuroscienceClinical psychologyMedicinePsychiatryMagnetic resonance imagingRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Widespread structural brain abnormalities have been consistently reported in schizophrenia, but their relation to the heterogeneous clinical manifestations remains unknown. In particular, it is un-clear whether anatomical abnormalities in discrete regions give rise to discrete symptoms, or whether distributed abnormalities give rise to the broad clinical profile associated with schizophrenia. Here we apply a multivariate data-driven approach to investigate covariance patterns between multiple symptom domains and distributed brain abnormalities in schizophrenia. Structural MRI, and clinical data were derived from one discovery sample (133 patients, 113 controls) and one independent validation sample (108 patients, 69 controls). Disease-related voxel-wise brain abnormalities were estimated using deformation based morphometry. Partial least squares analysis was used to comprehensively map clinical, neuropsychological and demographic data onto distributed deformation in a single multivariate model. The analysis identified three latent clinical-anatomical dimensions that collectively accounted for 55% of the covariance between clinical data and brain deformation. The first latent clinical-anatomical dimension was replicated in an independent sample, encompassing cognitive impairments, negative symptom severity and brain abnormalities within the default mode and visual networks. This cognitive-negative dimension was associated with low socioeconomic status and was represented across multiple races. Altogether, we identified a continuous cognitive-negative dimension of schizophrenia, centered on two intrinsic networks. By simultaneously taking into account both clinical manifestations and neuroanatomical abnormalities, the present results open new avenues for multi-omic stratification and biotyping of individuals with schizophrenia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,130
Tête enseignante GPT0,344
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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