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Enregistrement W3013942117 · doi:10.1080/00318884.2020.1735926

Reclassification of<i>Gonyaulax verior</i>(Gonyaulacales, Dinophyceae) as<i>Sourniaea diacantha gen. et comb. nov.</i>

2020· article· es· W3013942117 sur OpenAlexaff
Wei Zhang, Zhun Li, Kenneth Neil Mertens, Amélie Derrien, Vera Pospelova, M. Consuelo Carbonell-Moore, Siamak Bagheri, Kazumi Matsuoka, Hyeon Ho Shin, Haifeng Gu

Notice bibliographique

RevuePhycologia · 2020
Typearticle
Languees
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMarine Toxins and Detection Methods
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDinophyceaeBiologyRibosomal RNA16S ribosomal RNATaxonomy (biology)BotanyGeneZoologyGeneticsEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gonyaulax verior was initially described as Amylax diacantha from Belgian coastal waters a century ago but its detailed morphology needed restudy. Here, we established nine strains of G. verior by germinating cysts or isolating cells from localities from the European Atlantic to the Caspian Sea and the Pacific Ocean. Both cyst and thecal morphology were examined by light and scanning electron microscopy. SSU, LSU and/or ITS-5.8S rRNA gene sequences were obtained from all strains. Cells of G. verior have a plate formula of Po, 4′, 2a, 6-7′′, 6C, 6S, 6′′′, 1p, 1′′′′ with an L-type ventral organisation, characterised by two either straight or curved antapical horns of variable length. Cysts of G. verior are oval, smooth and contain one or two yellow accumulation bodies. The maximum-likelihood and Bayesian inference analyses based on SSU and LSU rRNA gene sequences revealed two clades of G. verior, referred to as ribotypes A and B. Genetic distances based on ITS-5.8S rRNA gene sequences within the same ribotype were less than 0.06, but greater than 0.32 between ribotypes. G. verior is reclassified as Sourniaea diacantha gen. et comb. nov., which is attributed to Lingulodiniaceae together with Pyxidinopsis, Lingulodinium and Amylax. Our results suggest that Lingulodiniaceae can be separated from Protoceratiaceae and Gonyaulacaceae based on ventral organisation, apical complex, ventral pore and number of anterior intercalary plates. One strain of S. diacantha was examined for yessotoxin production by LC-MS/MS but did not produce toxin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,538
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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