Mitochondrial DNA diversity in wild gaur (<i>Bos gaurus gaurus</i>): evidence from extant and historical samples
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Notice bibliographique
Résumé
Bos gaurus gaurus commonly called as gaur is a wild bovid species inhabiting South and Southeast Asia and attained vulnerable status in India. In this study, we typed 62 extant free-ranging wild gaur individuals for mitochondrial partial displacement loop (D-loop) and cytochrome b gene (Cyt b) from the Melghat Tiger Reserve (MTR). Two historical DNA samples originating from museums and two Tectona grandis bark fibers samples browsed by wild gaur were also used as a source of environmental DNA. Both D-loop and Cyt b loci show the occurrence of a single haplotype in the contemporary wild gaur population. While D-loop fragment sequencing of two historical museum samples reveals two unique haplotypes, virtually absent in the present wild gaur population of MTR. Amplifications of the similar haplotypes in gaur DNA samples obtained through chewed T. grandis bark fibers have proved the efficacy of eDNA. Bayesian Skyline Plot (BSP) analysis using extant and historical D-loop sequences illustrate population decline starting from upper Mesolithic. Also, the BSP graph indicates accelerated effective population size decline (Ne), a time period coinciding with the different phases of the ∼5000 years old Indus civilization. The plot shows an overall declining trend in the wild gaur population, a probable outcome of ever-shrinking habitat in the central Indian landscape caused by prehistoric, medieval and colonial hunting practices.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle