The modifying effect of nutritional factors on the association between IL1-β single nucleotide polymorphism and serum CXCL10 levels in young Canadian adults
Notice bibliographique
Résumé
Background: Genetic and nutritional factors play an important role in inflammatory response and diseases. CXCL10 is a critical biomarker that is involved in multiple inflammatory diseases, and elevated levels of CXCL10 have been associated with the development of several chronic and infectious diseases. In contrast, micronutrients can attenuate inflammatory responses. Single nucleotide polymorphisms in the pro-inflammatory cytokine genes such as IL-1β at rs16944 contributed to a number of inflammatory disorders and may substantiate the convergance between chronic and infectious diseases. Aim: This study aims to identify the modifying effect of nutritional factors on the association between IL-1β genotypes and CXCL10 levels. Methods: Participants ( N = 386) were healthy males and females from the Toronto Nutrigenomics and Health study recruited from the University of Toronto. Levels of micronutrients and inflammatory markers were measured in plasma. IL-1β genotypes were extracted from the Affymetrix 6.0 SNP chip. Results: CXCL10 levels were not different across different IL-1β genotypes. Among those with the GA genotype, elevated CXCL10 levels were observed with higher than median ascorbic acid (β = 0.004 ± 0.002, P = 0.047) or higher than median vitamin D status (β = 0.003 ± 0.002, P = 0.044). Among participants with the AA genotype, subjects with low α-tocopherol status had elevated levels of CXCL10 (β = −0.016 ± 0.007, P = 0.012). Conclusion: The association between IL-1β rs16944 genotype and CXCL10 levels was modified by the levels of ascorbic acid, α-tocopherol and vitamin D. These findings may aid in understanding the combined effect of genetic and dietary factors in the development of various infectious and chronic diseases in which IL-1β and CXCL10 may play an etiological role.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».