Abstract WMP116: Thromboembolism in Atrial Fibrillation: Relationship to Leukocyte Gene Expression
Notice bibliographique
Résumé
Background: Atrial fibrillation (AF) is an important cause of stroke, for which anticoagulation provides substantial benefit. However, not all patients with AF will have a stroke. There remains uncertainty regarding factors that promote thromboembolism and stroke in patients with AF. In this study we examined differences in blood cell gene expression unique to AF in acute stroke to better understand factors important to atrial fibrillation thromboembolism in human stroke. Methods: Gene expression in blood was compared in acute stroke patients with AF to non-AF stroke and to controls without stroke. Blood was collected in PAXgene tubes, and leukocyte/platelet gene expression was measured by Affymetrix microarray. Differentially expressed genes were identified using ANOVA adjusted for age, sex and batch. Results: In the 184 patients studied, 40 were acute strokes with AF, 143 had non-AF acute stroke, and 116 were non-stroke controls. There were 43 genes unique to AF in patients with stroke, and 69 genes associated AF that were shared between AF stroke and controls (FDR<0.05, fold change>|1.5|). Functional analysis indicate acute stroke AF genes are associated with changes in the hematological system including blood cell rheology and leukocyte activation. In contrast non-stroke AF genes are associated cardiac hypertrophy and blood vessel injury. Conclusions: AF has differences in blood cell gene expression in acute stroke that may relate to risk of thromboembolism. Acute stroke patients with AF display changes in blood cell rheology and leukocyte activation; whereas non-stroke AF patients have changes in cardiac hypertrophy and vascular injury. These differences are important to understanding blood cell contribution to thrombus formation and stroke risk in patients with AF. Further study is required to assess the relationship of these gene changes to stroke risk and response to anticoagulation in patients with AF.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».