Mapping crown rust resistance at multiple time points in elite oat germplasm
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Crown rust, caused by Puccinia coronata f. sp. avenae Erikss., is the most important disease impacting cultivated oat (Avena sativa L.). Genetic resistance is the most desirable management strategy. The genetic architecture of crown rust resistance is not fully understood, and previous mapping investigations have mostly ignored temporal variation. A collection of elite oat lines sourced from oat breeding programs in the American Upper Midwest and Canada was genotyped using a high-density genotyping-by-sequencing system and evaluated for crown rust disease severity at multiple time points throughout the growing season in three disease nursery environments. Genome-wide association mapping was conducted for disease severity on each observation date of each trial, area under the disease progress curve for each trial, heading date for each trial, and area under the disease progress curve in a multi-environment model. Crown rust resistance quantitative trait loci (QTL) were detected on linkage groups Mrg05, Mrg12, Mrg15, Mrg18, Mrg20, and Mrg33. None of these QTL were coincident with a days-to-heading QTL detected on Mrg02. Only the QTL detected on Mrg15 was detected in multiple mapping models. The QTL on Mrg05, Mrg12, Mrg18, Mrg20, and Mrg33 were detected on only a single observation date and were not detected on observations just days before and after. This result uncovers the importance of temporal variation in mapping experiments which is usually ignored. It is possible that high density temporal data could be used to more precisely characterize the nature of plant resistance in other systems.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle