MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3014398083 · doi:10.1515/cclm-2019-0292

Obesity status modifies the association between rs7556897T&gt;C in the intergenic region <i>SLC19A3</i>-<i>CCL20</i> and blood pressure in French children

2020· article· en· W3014398083 sur OpenAlexaff
Saïd El Shamieh, Maria G. Stathopoulou, Amélie Bonnefond, Ndeye Coumba Ndiaye, Cécile Lecœur, David Meyre, Sébastien Dadé, Pia Chedid, Ali Salami, Payman Shahabi, George Dedoussis, Philippe Froguel, Sophie Visvikis‐Siest

Notice bibliographique

RevueClinical Chemistry and Laboratory Medicine (CCLM) · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueRegulation of Appetite and Obesity
Établissements canadiensMcMaster UniversityImpact
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInternal medicineEndocrinologyMedicineOverweightObesityBlood pressureSingle-nucleotide polymorphismPopulationBiologyGenotypeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Growing evidence reports an association between inflammatory markers, obesity and blood pressure (BP). Specifically, the intergenic single nucleotide polymorphism (SNP) rs7556897T > C (MAF = 0.34) located between SLC19A3 and the CCL20 was shown to be associated with chronic inflammatory diseases. In addition, CCL20 expression was found increased in pancreatic islets of obese rodents and human pancreatic β cells under the influence of inflammation. In this study, we hypothesized that SNP rs7556897 could affect BP levels, thus providing a link between inflammation, BP and obesity. Methods BP was measured under supine position with a manual sphygmomanometer; values reported were the means of three readings. We analyzed rs7556897 in 577 normal weight and 689 obese French children. Using real-time polymerase chain reaction (PCR), we quantified CCL20 and SLC19A3 expression in adipose tissue and peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) of normal weight and overweight children. Results The rs7556897C allele was negatively associated with diastolic BP in normal weight children (β = -0.012 ± 0.004, p = 0.006) but positively associated in obese children (β = 2.178 ± 0.71, p = 0.002). A significant interaction between rs7556897T > C and the obesity status (obese or normal weight) was detected (β = 3.49, p = 9.79 × 10-5) for BP in a combined population analysis. CCL20 mRNA was only expressed in the adipose tissue of overweight children, and its expression levels were 10.7× higher in PBMCs of overweight children than normal weight children. Finally, CCL20 mRNA levels were positively associated with rs7556897T > C in PBMCs of 58 normal weight children (β = 0.43, p = 0.002). SLC19A3 was not expressed in PBMCs, and in adipose tissue, it showed same levels of expression in normal weight and overweight children. The gene expression results may highlight a specific involvement of CCL20 via communicating obesity/inflammation pathways that regulate BP. Conclusions Childhood obesity reverses the effect of rs7556897T > C on diastolic BP, possibly via the modulation of CCL20 expression levels.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,040
Score d'incertitude au seuil0,080

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueClinical Chemistry and Laboratory Medicine (CCLM)Même sujetRegulation of Appetite and ObesityTravaux en français237 207