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Enregistrement W3014446443 · doi:10.1186/s12874-020-00953-9

Validation of an algorithm based on administrative data to detect new onset of atrial fibrillation after cardiac surgery

2020· article· en· W3014446443 sur OpenAlexafffundabout
Jonathan Bourgon Labelle, Paul Farand, Christian Vincelette, Myriam Dumont, Mathilde Le Blanc, Christian M. Rochefort

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Research Methodology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAtrial Fibrillation Management and Outcomes
Établissements canadiensHôpital Charles-Le MoyneCentre Hospitalier Universitaire de SherbrookeUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchRéseau de recherche portant sur les interventions en sciences infirmières du QuébecUniversité de Sherbrooke
Mots-clésMedicineAtrial fibrillationCardiac surgeryIncidence (geometry)Diagnosis codeGold standard (test)Medical recordComplicationPositive predicative valueLikelihood ratios in diagnostic testingAlgorithmInternal medicineEmergency medicineCardiologyPredictive valuePopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Postoperative atrial fibrillation (POAF) is a frequent complication of cardiac surgery associated with important morbidity, mortality, and costs. To assess the effectiveness of preventive interventions, an important prerequisite is to have access to accurate measures of POAF incidence. The aim of this study was to develop and validate such a measure. METHODS: A validation study was conducted at two large Canadian university health centers. First, a random sample of 976 (10.4%) patients who had cardiac surgery at these sites between 2010 and 2016 was generated. Then, a reference standard assessment of their medical records was performed to determine their true POAF status on discharge (positive/negative). The accuracy of various algorithms combining diagnostic and procedure codes from: 1) the current hospitalization, and 2) hospitalizations up to 6 years before the current hospitalization was assessed in comparison with the reference standard. Overall and site-specific estimates of sensitivity, specificity, positive (PPV), and negative (NPV) predictive values were generated, along with their 95%CIs. RESULTS: Upon manual review, 324 (33.2%) patients were POAF-positive. Our best-performing algorithm combining data from both sites used a look-back window of 6 years to exclude patients previously known for AF. This algorithm achieved 70.4% sensitivity (95%CI: 65.1-75.3), 86.0% specificity (95%CI: 83.1-88.6), 71.5% PPV (95%CI: 66.2-76.4), and 85.4% NPV (95%CI: 82.5-88.0). However, significant site-specific differences in sensitivity and NPV were observed. CONCLUSION: An algorithm based on administrative data can identify POAF patients with moderate accuracy. However, site-specific variations in coding practices have significant impact on accuracy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,016
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,132
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,853
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0160,132
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,747
Tête enseignante GPT0,581
Écart entre enseignants0,166 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2020
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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