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Enregistrement W3014563464 · doi:10.1038/s41375-020-0808-y

H3K79me2/3 controls enhancer–promoter interactions and activation of the pan-cancer stem cell marker PROM1/CD133 in MLL-AF4 leukemia cells

2020· article· en· W3014563464 sur OpenAlexfundno aff
Laura Godfrey, Nicholas T. Crump, Sorcha O’Byrne, I‐Jun Lau, Siobhan Rice, Joe Harman, Thomas Jackson, Natalina Elliott, Gemma Buck, Christopher Connor, Ross Thorne, David J. H. F. Knapp, Olaf Heidenreich, Paresh Vyas, Pablo Menéndez, Sarah Inglott, Philip Ancliff, Huimin Geng, Irene Roberts, Anindita Roy, Thomas A. Milne

Notice bibliographique

RevueLeukemia · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCAR-T cell therapy research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchBlood Cancer UKUniversity of OxfordResearch Councils UKBloodwiseWellcome TrustLady Tata Memorial TrustMinisterio de Economía y CompetitividadCancer Research UKLeukaemia UKMedical Research FoundationNational Institute for Health and Care ResearchEuropean Hematology Association
Mots-clésLeukemiaBiologyStem cellCancer researchEnhancerCancer stem cellCancerGeneticsGeneTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MLL gene rearrangements (MLLr) are a common cause of aggressive, incurable acute lymphoblastic leukemias (ALL) in infants and children, most of which originate in utero. The most common MLLr produces an MLL-AF4 fusion protein. MLL-AF4 promotes leukemogenesis by activating key target genes, mainly through recruitment of DOT1L and increased histone H3 lysine-79 methylation (H3K79me2/3). One key MLL-AF4 target gene is PROM1, which encodes CD133 (Prominin-1). CD133 is a pentaspan transmembrane glycoprotein that represents a potential pan-cancer target as it is found on multiple cancer stem cells. Here we demonstrate that aberrant PROM1/CD133 expression is essential for leukemic cell growth, mediated by direct binding of MLL-AF4. Activation is controlled by an intragenic H3K79me2/3 enhancer element (KEE) leading to increased enhancer-promoter interactions between PROM1 and the nearby gene TAPT1. This dual locus regulation is reflected in a strong correlation of expression in leukemia. We find that in PROM1/CD133 non-expressing cells, the PROM1 locus is repressed by polycomb repressive complex 2 (PRC2) binding, associated with reduced expression of TAPT1, partially due to loss of interactions with the PROM1 locus. Together, these results provide the first detailed analysis of PROM1/CD133 regulation that explains CD133 expression in MLLr ALL.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations67
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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