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Enregistrement W3014584416 · doi:10.7488/era/239

Development of machine learning schemes for segmentation, characterisation, and evolution prediction of white matter hyperintensities in structural brain MRI

2020· dissertation· en· W3014584416 sur OpenAlexfundno aff
Muhammad Febrian Rachmadi

Notice bibliographique

RevueERA · 2020
Typedissertation
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueMedical Image Segmentation Techniques
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthUK Dementia Research InstituteLembaga Pengelola Dana PendidikanEisaiFondation LeducqMrs Gladys Row Fogo Charitable TrustBioClinicaEuropean CommissionU.S. Department of DefenseAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeUniversity of Southern CaliforniaWellcome TrustUniversity of EdinburghNorthern California Institute for Research and EducationNvidiaBristol-Myers SquibbEli Lilly and CompanyBiogenAlzheimer's Association
Mots-clésHyperintensityWhite matterArtificial intelligenceSegmentationPattern recognition (psychology)Computer scienceMagnetic resonance imagingMedicineRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

White matter hyperintensities (WMH) are neuroradiological features seen in T2 Fluid-Attenuated Inversion Recovery (T2-FLAIR) brain magnetic resonance imaging (MRI) and have been commonly associated with stroke, ageing, dementia, and Alzheimer’s disease (AD) progression. As a marker of neuro-degenerative disease, WMH may change over time and follow the clinical condition of the patient. In contrast to the early longitudinal studies of WMH, recent studies have suggested that the progression of WMH may be a dynamic, non-linear process where different clusters of WMH may shrink, stay unchanged, or grow. In this thesis, these changes are referred to as the “evolution of WMH”. The main objective of this thesis is to develop machine learning methods for prediction of WMH evolution in structural brain MRI from one-time (baseline) assessment. Predicting the evolution of WMH is challenging because the rate and direction of WMH evolution varies greatly across previous studies. Furthermore, the evolution of WMH is a non-deterministic problem because some clinical factors that possibly influence it are still not known. In this thesis, different learning schemes of deep learning algorithm and data modalities are proposed to produce the best estimation of WMH evolution. Furthermore, a scheme to simulate the non-deterministic nature of WMH evolution, named auxiliary input, was also proposed. In addition to the development of prediction model for WMH evolution, machine learning methods for segmentation of early WMH, characterisation of WMH, and simulation of WMH progression and regression are also developed as parts of this thesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
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