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Enregistrement W3014608058 · doi:10.1101/2020.03.31.018952

Chandelier cell anatomy and function reveal a variably distributed but common signal

2020· preprint· en· W3014608058 sur OpenAlexaff
Casey M Schneider-Mizell, Ágnes L. Bodor, Forrest Collman, Derrick Brittain, Adam Bleckert, Sven Dorkenwald, Nicholas L. Turner, Thomas Macrina, Kisuk Lee, Ran Lu, Jingpeng Wu, Jun Zhuang, Anirban Nandi, Brian Hu, JoAnn Buchanan, Marc Takeno, Russel Torres, Gayathri Mahalingam, Daniel J. Bumbarger, Yang Li, Nico Kemnitz, William Silversmith, Dodam Ih, Jonathan Zung, Aleksandar Zlateski, Ignacio Tartavull, Sergiy Popovych, William S. Wong, Manuel Castro, Chris S. Jordan, Emmanouil Froudarakis, Lynne A. Becker, Shelby Suckow, Jacob Reimer, Andreas S. Tolias, Costas A. Anastassiou, H. Sebastian Seung, R. Clay Reid, Nuno Maçarico da Costa

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeural dynamics and brain function
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Eye InstituteNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Mental HealthArmy Research OfficeInterior Business CenterG. Harold and Leila Y. Mathers FoundationIntelligence Advanced Research Projects ActivityNational Institutes of Health
Mots-clésSomaNeuroscienceInhibitory postsynaptic potentialInterneuronVisual cortexNeuronBiologyExcitatory postsynaptic potentialCell typePopulationCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The activity and connectivity of inhibitory cells has a profound impact on the operation of neuronal networks. While the average connectivity of many inhibitory cell types has been characterized, we still lack an understanding of how individual interneurons distribute their synapses onto their targets and how heterogeneous the inhibition is onto different individual excitatory neurons. Here, we use large-scale volumetric electron microscopy (EM) and functional imaging to address this question for chandelier cells in layer 2/3 of mouse visual cortex. Using dense morphological reconstructions from EM, we mapped the complete chandelier input onto 153 pyramidal neurons. We find that the number of input synapses is highly variable across the population, but the variability is correlated with structural features of the target neuron: soma depth, soma size, and the number of perisomatic synapses received. Functionally, we found that chandelier cell activity in vivo was highly correlated and tracks pupil diameter, a proxy for arousal state. We propose that chandelier cells provide a global signal whose strength is individually adjusted for each target neuron. This approach, combining comprehensive structural analysis with functional recordings of identified cell types, will be a powerful tool to uncover the wiring rules across the diversity of cortical cell types.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,068
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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