Association Between BMI and DNA Methylation in Blood or Normal Adult Breast Tissue: A Systematic Review
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND/AIM: Several studies have investigated the influence of obesity on DNA methylation (DNAm) to find biomarkers associated with the detection of chronic diseases, including breast cancer. The aim of the study was to systematically review studies examining the association of body mass index (BMI) and DNAm in blood or normal breast tissue. MATERIALS AND METHODS: Three scientific literature databases (PubMed, Embase and Web of Science) were screened until May 2018. RESULTS: Twenty-four studies were included along with ours in which we investigated this relation in the normal breast tissue of 40 breast cancer patients. CONCLUSION: BMI-associated CpG sites were highly variable with few identified in less than half of the studies. Nevertheless, a few genes potentially associated with BMI were highlighted in blood (CPT1A, ABCG1, SREBF1 and LGALS3BP) and in normal breast tissue (PTPRN2 and ABLIM2). The variability of the results could be explained by the tissue and cell-specificity of methylation and differences in methodology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,014 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,005 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,008 | 0,009 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».