LC–HRMS and Chemical Derivatization Strategies for the Structure Elucidation of Caribbean Ciguatoxins: Identification of C-CTX-3 and -4
Notice bibliographique
Résumé
Ciguatera poisoning is linked to the ingestion of seafood that is contaminated with ciguatoxins (CTXs). The structural variability of these polyether toxins in nature remains poorly understood due to the low concentrations present even in highly toxic fish, which makes isolation and chemical characterization difficult. We studied the mass spectrometric fragmentation of Caribbean CTXs, i.e., the epimers C-CTX-1 and -2 (1 and 2), using a sensitive UHPLC–HRMS/MS approach in order to identify product ions of diagnostic value. We found that the fragmentation of the ladder-frame backbone follows a characteristic pattern and propose a generalized nomenclature for the ions formed. These data were applied to the structural characterization of a pair of so far poorly characterized isomers, C-CTX-3 and -4 (3 and 4), which we found to be reduced at C-56 relative to 1 and 2. Furthermore, we tested and applied reduction and oxidation reactions, monitored by LC–HRMS, in order to confirm the structures of 3 and 4. Reduction of 1 and 2 with NaBH4 afforded 3 and 4, thereby unambiguously confirming the identities of 3 and 4. In summary, this work provides a foundation for mass spectrometry-based characterization of new C-CTXs, including a suite of simple chemical reactions to assist the examination of structural modifications.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».