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Enregistrement W3014817644 · doi:10.7554/elife.54216.sa1

Decision letter: Competition between kinesin-1 and myosin-V defines Drosophila posterior determination

2020· peer-review· en· W3014817644 sur OpenAlexaff
Yukiko Yamashita, Paul Lasko

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepeer-review
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésKinesinMicrotubuleMyosinBiologyActinCell biologyMotor proteinCytoskeletonoskarCell cortexAnatomyGeneticsCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

One of the most fundamental steps of embryonic development is deciding which end of the body should be the head, and which should be the tail. Known as 'axis specification', this process depends on the location of genetic material called mRNAs. In fruit flies, for example, the tail-end of the embryo accumulates an mRNA called oskar. If this mRNA is missing, the embryo will not develop an abdomen. The build-up of oskar mRNA happens before the egg is even fertilized and depends on two types of scaffold proteins in the egg cell called microtubules and microfilaments. These scaffolds act like ‘train tracks’ in the cell and have associated protein motors, which work a bit like trains, carrying cargo as they travel up and down along the scaffolds. For microtubules, one of the motors is a protein called kinesin-1, whereas for microfilaments, the motors are called myosins. Most microtubules in the egg cell are pointing away from the membrane, while microfilament tracks form a dense network of randomly oriented filaments just underneath the membrane. It was already known that kinesin-1 and a myosin called myosin-V are important for localizing oskar mRNA to the posterior of the egg. However, it was not clear why the mRNA only builds up in that area. To find out, Lu et al. used a probe to track oskar mRNA, while genetically manipulating each of the motors so that their ability to transport cargo changed. Modulating the balance of activity between the two motors revealed that kinesin-1 and myosin-V engage in a tug-of-war inside the egg: myosin-V tries to keep oskar mRNA underneath the membrane of the cell, while kinesin-1 tries to pull it away from the membrane along microtubules. The winner of this molecular battle depends on the number of microtubule tracks available in the local area of the cell. In most parts of the cell, there are abundant microtubules, so kinesin-1 wins and pulls oskar mRNA away from the membrane. But at the posterior end of the cell there are fewer microtubules, so myosin-V wins, allowing oskar mRNA to localize in this area. Artificially 'shaving' some microtubules in a local area immediately changed the outcome of this tug-of-war creating a build-up of oskar mRNA in the 'shaved' patch. This is the first time a molecular tug-of-war has been shown in an egg cell, but in other types of cell, such as neurons and pigment cells, myosins compete with kinesins to position other molecular cargoes. Understanding these processes more clearly sheds light not only on embryo development, but also on cell biology in general.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,080
Score d'incertitude au seuil0,268

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0050,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0170,011
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0800,059

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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