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Enregistrement W3014900409 · doi:10.1021/acs.jpca.0c00421

Chemical Shift Tensors of Cimetidine Form A Modeled with Density Functional Theory Calculations: Implications for NMR Crystallography

2020· article· en· W3014900409 sur OpenAlexfundno aff
Sean T. Holmes, Olivia G. Engl, Matthew N. Srnec, Jeffry D. Madura, Rosalynn Quiñones, James K. Harper, Robert W. Schurko, Robbie J. Iuliucci

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry A · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueAdvanced NMR Techniques and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDivision of ChemistryNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaDivision of Materials ResearchGenentechFlorida State UniversityCanada Foundation for InnovationNational High Magnetic Field LaboratoryState of FloridaOntario Innovation TrustUniversity of Windsor
Mots-clésDensity functional theoryElectromagnetic shieldingChemical shiftHybrid functionalBasis setCarbon-13 NMRComputational chemistryChemistryMaterials scienceMolecular physicsPhysical chemistryStereochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The principal components of the 13 C chemical shift tensors for the ten crystallographically distinct carbon atoms of the active pharmaceutical ingredient cimetidine Form A have been measured using the FIREMAT technique. Density functional theory (DFT) calculations of 13 C and 15 N magnetic shielding tensors are used to assign the 13 C and 15 N peaks. DFT calculations were performed on cimetidine and a training set of organic crystals using both plane-wave and cluster-based approaches. The former set of calculations allowed several structural refinement strategies to be employed, including calculations utilizing a dispersion-corrected force field that was parametrized using 13 C and 15 N magnetic shielding tensors. The latter set of calculations featured the use of resource-intensive hybrid-DFT methods for the calculation of magnetic shielding tensors. Calculations on structures refined using the new force-field correction result in improved values of 15 N magnetic shielding tensors (as gauged by agreement with experimental chemical shift tensors), although little improvement is seen in the prediction of 13 C shielding tensors. Calculations of 13 C and 15 N magnetic shielding tensors using hybrid functionals show better agreement with experimental values in comparison to those using GGA functionals, independent of the method of structural refinement; the shielding of carbon atoms bonded to nitrogen are especially improved using hybrid DFT methods.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,030

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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