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Enregistrement W3015055090 · doi:10.1101/2020.04.01.020768

Gene deletion studies reveal a critical role for prostamide/prostaglandin F <sub>2α</sub> synthase in prostamide F <sub>2α</sub> formation

2020· preprint· en· W3015055090 sur OpenAlexaff
Jacques Bertrand, David F. Woodward, Joseph M. Sherwood, Alice Spenlehauer, Cristoforo Silvestri, Fabiana Piscitelli, Vincenzo Di Marzo, Maya Yamazaki, Kenji Sakimura, Kikuko Watanabe, Darryl R. Overby

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlaucoma and retinal disorders
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of ScienceAllergan
Mots-clésProstaglandinProstanoidIntraocular pressureThromboxane-A synthaseChemistryInternal medicineEndocrinologyATP synthaseEnzymeBiochemistryBiologyMedicineOphthalmologyArachidonic acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Prostamide / prostaglandin F synthase (PM/PGFS) is an enzyme with very narrow substrate specificity and is dedicated to the biosynthesis of prostamide and prostaglandin F 2α. The importance of this enzyme, relative to the aldoketoreductase (AKR) series, in providing functional tissue prostamide F 2α levels was determined by creating a line of PM/PGFS gene deleted mice. Deletion of the gene encoding PM/PGFS (fam213b) was accomplished by a two exon disruption. Prostamide F 2α levels in WT and PM/PGFS KO mice were determined by LC/MS/MS. Intraocular pressure was measured by tonometry and outflow facility was measured by the iPerfusion method in enucleated mouse eyes. Deletion of fam213b had no observed effect on behavior, appetite, or fertility. Intraocular pressure was significantly elevated by approximately 4 mmHg in PM/PGFS KO mice compared to littermate WT mice. No effect on pressure dependent outflow facility occurred, which is consistent with the typically reported prostanoid effect of increasing outflow through the unconventional pathway. The elevation of intraocular pressure caused by deletion of the gene encoding the PM/PGFS enzyme likely results from a diversion of the endoperoxide precursor pathway to provide increased levels of those prostanoids that raise intraocular pressure, namely prostaglandin D 2 (PGD 2 ), thromboxane A 2 (TxA 2 ). It follows that PM/PGFS may serve an important regulatory role in the eye by providing PGF 2α and prostamide F 2α to constrain the influence of those prostanoids that raise intraocular pressure.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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