<i>Lactobacillus pentosus</i> KCA1 Decreases Vaginal and Gut Microbiota Associated with Bacterial Vaginosis (BV), Down-regulates IL-1 beta in Women of Child-Bearing Age and Modulates Bacterial Genes Related to Metabolic Functions
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Introduction Bacterial vaginosis which affects 14-50% of reproductive-aged women in Nigeria is misdiagnosed and under-reported. Treatment option is antibiotics, which leads to recurrent infections. The objectives of this study are three folds, first to determine effects of oral feeding of Lactobacillus pentosus KCA1 on the vaginal and gut microbiota of women diagnosed with BV; to measure the level of two proinflammatory cytokines IL-1 beta, before and after KCA1 consumption and to determine the relative abundance of bacterial metabolic genes. Methods Seven women diagnosed with BV by Nugent score (7-10) were recruited to provide vaginal and gut sample before and after 14 days oral intake of 3 grams of Lactobacillus pentosus KCA1. The DNA from the swabs were processed for 16S rRNA metagenomics using Illumina MiSeq platform. The paired-end sequence FASTQ reads were imported into Illumina Basespace pipeline for quality check (QC). In addition, EzBioCloud pipeline was use for alpha and beta diversity estimation using PKSSU4.0 version and open reference UCLUST_MC2 for OTUs picking at 97% cut-off. Blood samples were analyzed using ELISA technique. PICRUSt was used to predict the metabolic functions from the 16S rRNA gene dataset. Results On average, there was no significant difference at p=0.05 in the alpha indices typified by Shannon index. The beta diversity showed different clustering positions with PCoA. However, at individual taxonomic categories, there was a significant decrease in the relative abundance of some genera associated with bacterial vaginosis after KCA1 feeding with a corresponding increase of Lactobacillus genera. Bacterial genes related to defence systems were up-regulated in the vagina. There was a 2-fold down-regulation of IL-1 beta after consumption of KCA1. Conclusion Our findings suggest that Lactobacillus pentosus KCA1 taken orally, lowers pro-inflammatory cytokine, IL-1 beta and decreases the relative abundance of BV-associated bacteria.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».