MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3015068689 · doi:10.1111/vcp.12843

Multicenter flow cytometry proficiency testing of canine blood and lymph node samples

2020· article· en· W3015068689 sur OpenAlexaff
Kristina Meichner, Tracy Stokol, Jaime L. Tarigo, Anne C. Avery, Mary Jo Burkhard, S. Comazzi, Jonathan E. Fogle, Devorah M. Stowe, Barbara C. Rütgen, Davis Seelig, Adi Wasserkrug‐Naor, William Vernau, Dorothee Bienzle

Notice bibliographique

RevueVeterinary Clinical Pathology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueVeterinary Oncology Research
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésConcordanceMedicineKappaLymph nodeCohen's kappaSample (material)External quality assessmentSample size determinationFlow cytometryPathologyMedical physicsInternal medicineStatisticsImmunologyMathematicsChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Flow cytometry (FC) is used increasingly in veterinary medicine for further characterization of hematolymphoid cells. Guidelines for optimizing assay performance and interpretation of results are limited, and concordance of results across laboratories is unknown. OBJECTIVES: This study aimed to determine inter-investigator agreement on the interpretation of FC results from split samples analyzed in different laboratories using various protocols, cytometers, and software; and on the interpretation of archived FC standard (FCS) data files contributed by the different investigators. METHODS: This was a multicenter observational cross-sectional study. Anticoagulated blood or lymph node aspirate samples from nine client-owned dogs were aliquoted and shipped to participating laboratories. Samples were analyzed with individual laboratory-developed protocols. In addition, FCS files from a set of separate samples from 11 client-owned dogs were analyzed by participating investigators. A person not associated with the study tabulated the results and interpretations. Agreement of interpretations was assessed with Fleiss' kappa statistic. RESULTS: Prolonged transit times affected sample quality for some laboratories. Overall agreement among investigators regarding the FC sample interpretation was strong (κ = 0.86 ± 0.19, P < .001), and for specific categories, ranged from moderate to perfect. Agreement of the lymphoproliferation or other leukocyte sample category from the analysis of the FCS files was weak (κ = 0.58 ± 0.05, P < .001). CONCLUSIONS: Lymphoproliferations were readily identified by FC, but identification of the categories of hematolymphoid neoplasia in fresh samples or archived files was variable. There is a need for a more standardized approach to maximize the enormous potential of FC in veterinary medicine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,306
Score d'incertitude au seuil0,756

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,257
Tête enseignante GPT0,444
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueVeterinary Clinical PathologyMême sujetVeterinary Oncology ResearchTravaux en français237 207