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Enregistrement W3015386370 · doi:10.1016/j.jprot.2020.103779

The impact of rattlesnake venom on mice cerebellum proteomics points to synaptic inhibition and tissue damage

2020· article· en· W3015386370 sur OpenAlexfundno aff
Fabio Montoni, Diana Zukas Andreotti, Rosangela Aparecida dos Santos Eichler, Wellington da Silva Santos, Carolina Yukiko Kisaki, Stephanie Santos Suehiro Arcos, Ismael Feitosa Lima, Magna Aparecida Maltauro Soares, Milton Yutaka Nishiyama, Daniel Nava Rodrigues, Emer S. Ferro, Valdemir Melechco Carvalho, Leo Kei Iwai

Notice bibliographique

RevueJournal of Proteomics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVenomous Animal Envenomation and Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoUniversidade de São PauloCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloSoil Science Society of AmericaWild Sheep Society of British Columbia
Mots-clésVenomProteomicsCerebellumBiologyNeuroscienceEcologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Snake envenomation is responsible for more than 130,000 deaths worldwide. In Brazil, the Crotalus rattlesnake is responsible for the second largest number of accidental snake bites in the country. Although there are many descriptions of the clinical and biochemical effects of Crotalus envenoming, there are few works describing the molecular events in the central nervous system of an organism due to envenomation. In this study, we analyzed the proteomic effect of Crotalus durissus terrificus snake venom on mice cerebellums. To monitor the envenomation over time, changes in the protein abundance were evaluated at 1 h, 6 h, 12 h and 24 h after venom injection by mass spectrometry. The analysis of the variation of over 4600 identified proteins over time showed a reduction in components of inhibitory synapse signaling, oxidative stress, and maintenance of neuronal cells, which paralleled increasing tissue damage and apoptosis factors. These analyses revealed the potential protein targets of the C. d. terrificus venom on the murine cerebellum, showing new aspects of the snake envenomation effect. These data may contribute to new therapeutic approaches (i.e., approaches directed at protein targets affected by the envenomation) on the treatment of envenomation by the neurotoxic C. d. terrificus snake venom. SIGNIFICANCE: Snakebites are a neglected global health problem that affects mostly rural and tropical areas of developing countries. It is estimated that over 5.4 million people are bitten by snakes each year, from which 2.7 million people are bitten by venomous snakes, resulting in disabilities such as amputations and in some cases leading to death. The C. d. terrificus snake is the most lethal snake in Brazil. Studying the molecular changes upon envenomation in a specific tissue may lead to a better understanding of the envenomation process by C. d. terrificus snakebites.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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