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Enregistrement W3015643973 · doi:10.3390/v12040409

Influenza PB1-F2 Inhibits Avian MAVS Signaling

2020· article· en· W3015643973 sur OpenAlexafffund
Yanna Xiao, Danyel Evseev, Chase A. Stevens, Adam Moghrabi, Domingo Miranzo-Navarro, Ximena Fleming-Canepa, David G Tetrault, Katharine E. Magor

Notice bibliographique

RevueViruses · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyRIG-IInterferonCell biologyInnate immune systemSignal transductionTransfectionImmunoprecipitationVirologySignal transducing adaptor proteinInfluenza A virusUbiquitinVirusCell cultureGeneImmune systemGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

RIG-I plays an essential role in the duck innate immune response to influenza infection. RIG-I engages the critical adaptor protein mitochondrial antiviral signaling (MAVS) to activate the downstream signaling pathway. The influenza A virus non-structural protein PB1-F2 interacts with MAVS in human cells to inhibit interferon production. As duck and human MAVS share only 28% amino acid similarity, it is not known whether the influenza virus can similarly inhibit MAVS signaling in avian cells. Using confocal microscopy we show that MAVS and the constitutively active N-terminal end of duck RIG-I (2CARD) co-localize in DF-1 cells, and duck MAVS is pulled down with GST-2CARD. We establish that either GST-2CARD, or duck MAVS can initiate innate signaling in chicken cells and their co-transfection augments interferon-beta promoter activity. Demonstrating the limits of cross-species interactions, duck RIG-I 2CARD initiates MAVS signaling in chicken cells, but works poorly in human cells. The D122A mutation of human 2CARD abrogates signaling by affecting MAVS engagement, and the reciprocal A120D mutation in duck 2CARD improves signaling in human cells. We show mitochondrial localization of PB1-F2 from influenza A virus strain A/Puerto Rico/8/1934 (H1N1; PR8), and its co-localization and co-immunoprecipitation with duck MAVS. PB1-F2 inhibits interferon-beta promoter activity induced by overexpression of either duck RIG-I 2CARD, full-length duck RIG-I, or duck MAVS. Finally, we show that the effect of PB1-F2 on mitochondria abrogates TRIM25-mediated ubiquitination of RIG-I CARD in both human and avian cells, while an NS1 variant from the PR8 influenza virus strain does not.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,335
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,008

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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